SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID275.01
Glaukom (GLC) : 27 Gene (53,520 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ASB10 603383 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1F) SNV und CNV: Short Read NGS
ATOH7 221900 AR Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1, PHPVAR) SNV und CNV: Short Read NGS
CDKN2B 600431 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1) SNV und CNV: Short Read NGS
COL8A2 136800 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1, FECD1) SNV und CNV: Short Read NGS
COL18A1 618880 AD Primäres Engwinkelglaukom (GLCC) SNV und CNV: Short Read NGS
CPAMD8 617319 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD8) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP1B1 231300 AR Primäres kongenitales Glaukom (GLC3A) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP1B1 617315 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD6) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXC1 601631 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD3) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXE3 610256 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD2) SNV und CNV: Short Read NGS
GPATCH3 231300 AR Primäres kongenitales Glaukom (GLC3) SNV und CNV: Short Read NGS
LMX1B 161200 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1, NPS) SNV und CNV: Short Read NGS
LTBP2 613086 AR Primäres kongenitales Glaukom (GLC3D) SNV und CNV: Short Read NGS
MYOC 137750 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1A) SNV und CNV: Short Read NGS
NTF4 613100 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1O) SNV und CNV: Short Read NGS
OPA1 606657 AD Prädisposition für Normaldruckglaukom (NTG) SNV und CNV: Short Read NGS
OPTN 137760 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1E) SNV und CNV: Short Read NGS
OPTN 606657 AD Prädisposition für Normaldruckglaukom (NTG) SNV und CNV: Short Read NGS
PAX6 604229 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD5) SNV und CNV: Short Read NGS
PITX2 137600 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD4) SNV und CNV: Short Read NGS
PITX3 107250 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD1) SNV und CNV: Short Read NGS
PXDN 269400 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD7) SNV und CNV: Short Read NGS
RAMP2 605154 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1) SNV und CNV: Short Read NGS
SIX6 606323 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC4A11 217700 AR Primäres kongenitales Glaukom (GLC3, CHED) SNV und CNV: Short Read NGS
TBK1 177700 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1P) SNV und CNV: Short Read NGS
TEK 617272 AR Primäres kongenitales Glaukom (GLC3E) SNV und CNV: Short Read NGS
TMCO1 213980 AR Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1, CFSMR) SNV und CNV: Short Read NGS
WDR36 609887 AD Primäres Offenwinkelglaukom (GLC1G) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Primäres Glaukom (GLC1, GLC3)
ASB10, ATOH7, CDKN2B, COL18A1, COL8A2, CYP1B1, GPATCH3, LMX1B, LTBP2, MYOC, NTF4, OPA1, OPTN, RAMP2, SIX6, SLC4A11, TBK1, TEK, TMCO1, WDR36
Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD)
CPAMD8, CYP1B1, FOXC1, FOXE3, PAX6, PITX2, PITX3, PXDN
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ASB10, ATOH7, CDKN2B, COL18A1, COL8A2, CPAMD8, CYP1B1, FOXC1, FOXE3, GPATCH3, LMX1B, LTBP2, MYOC, NTF4, OPA1, OPTN, PAX6, PITX2, PITX3, PXDN, RAMP2, SIX6, SLC4A11, TBK1, TEK, TMCO1, WDR36
HPO Terms
Open angle glaucoma, Ocular hypertension, Increased cup-to-disc ratio, Glaucomatous visual field defect, Primary congenital glaucoma, Late onset congenital glaucoma, Developmental glaucoma, Angle closure glaucoma, Glaucoma, Optic disc pallor, Optic neuropathy, Visual field defect, Peripapillary atrophy, Progressive visual loss, Shallow anterior chamber, Peripheral visual field loss, Optic nerve dysplasia, Hyphema, Photophobia, Visual loss
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