SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID063.00
Kongenitale extraokuläre Muskelfibrose (CFEOM) : 5 Gene (10,497 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
COL25A1 616219 AR CFEOM5 SNV und CNV: Short Read NGS
KIF21A 135700 AD CFEOM1 SNV und CNV: Short Read NGS
KIF21A 135700 AD CFEOM3B SNV und CNV: Short Read NGS
PHOX2A 602078 AR CFEOM2 SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB2B 610031 AD CFEOM SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB3 600638 AD CFEOM3A SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kongenitale extraokuläre Muskelfibrose (CFEOM)
COL25A1, KIF21A, KIF21A, PHOX2A, TUBB2B, TUBB3
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
COL25A1, KIF21A, PHOX2A, TUBB2B, TUBB3
HPO Terms
Ptosis, Ophthalmoplegia, Limited extraocular movements, Limited vertical eye movements, Limited horizontal eye movements, Strabismus, Esotropia, Exotropia, Nystagmus, Microphthalmia, Vertical gaze palsy, Abducens nerve palsy, Oculomotor nerve palsy, Limited abduction, Limited adduction, Limited elevation, Limited depression, Abnormal ocular movements, Congenital ptosis, Limited upward gaze
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