SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID187.01
Lebersche kongenitale Amaurose (LCA) : 19 Gene (38,823 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AIPL1 604393 AR LCA4 SNV und CNV: Short Read NGS
CEP290 611755 AR LCA10 SNV und CNV: Short Read NGS
CRB1 613835 AR LCA8 SNV und CNV: Short Read NGS
CRX 613829 AR LCA7 SNV und CNV: Short Read NGS
GDF6 615360 AR LCA17 SNV und CNV: Short Read NGS
GUCY2D 204000 AR LCA1 SNV und CNV: Short Read NGS
IMPDH1 613837 AD LCA11 SNV und CNV: Short Read NGS
KCNJ13 614186 AR LCA16 SNV und CNV: Short Read NGS
LCA5 604837 AR LCA5 SNV und CNV: Short Read NGS
LRAT 613341 AR LCA14 SNV und CNV: Short Read NGS
NMNAT1 608553 AR LCA9 SNV und CNV: Short Read NGS
PRPH2 608133 AR LCA18 SNV und CNV: Short Read NGS
RD3 610612 AR LCA12 SNV und CNV: Short Read NGS
RDH12 612712 AR LCA13 SNV und CNV: Short Read NGS
RPE65 204100 AR LCA2 SNV und CNV: Short Read NGS
RPGRIP1 613826 AR LCA6 SNV und CNV: Short Read NGS
SPATA7 604232 AR LCA3 SNV und CNV: Short Read NGS
TULP1 613843 AR LCA15 SNV und CNV: Short Read NGS
USP45 618513 AR LCA19 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Lebersche kongenitale Amaurose (LCA)
AIPL1, CEP290, CRB1, CRX, GDF6, GUCY2D, IMPDH1, KCNJ13, LCA5, LRAT, NMNAT1, PRPH2, RD3, RDH12, RPE65, RPGRIP1, SPATA7, TULP1, USP45
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AIPL1, CEP290, CRB1, CRX, GDF6, GUCY2D, IMPDH1, KCNJ13, LCA5, LRAT, NMNAT1, PRPH2, RD3, RDH12, RPE65, RPGRIP1, SPATA7, TULP1, USP45
HPO Terms
Congenital blindness, Severely reduced visual acuity, Reduced visual acuity, Progressive visual loss, Retinal dystrophy, Rod-cone dystrophy, Undetectable light- and dark-adapted electroretinogram, Abnormal electroretinogram, Abnormal full-field electroretinogram, Nystagmus, Pendular nystagmus, Retinal atrophy, Abnormal retinal pigmentation, Bone spicule pigmentation of the retina, Attenuation of retinal blood vessels, Abnormal fundus pigmentation, Photoreceptor outer segment loss on macular OCT, Visual impairment, Color vision defect
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