SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID082.02
Okulokutaner Albinismus (OCA) : 9 Gene (13,242 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
DCT 619165 AR OCA8 SNV und CNV: Short Read NGS
GPR143 300500 XL Okulärer Albinismus (OA1) SNV und CNV: Short Read NGS
LRMDA 615179 AR OCA7 SNV und CNV: Short Read NGS
MC1R 214500 AR OCA SNV und CNV: Short Read NGS
OCA2 203200 AR OCA2 SNV und CNV: Short Read NGS
SLC24A5 113750 AR OCA6 SNV und CNV: Short Read NGS
SLC45A2 606574 AR OCA4 SNV und CNV: Short Read NGS
TYR 203100 AR OCA1A SNV und CNV: Short Read NGS
TYR 606952 AR OCA1B SNV und CNV: Short Read NGS
TYRP1 203290 AR OCA3 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Okulokutaner Albinismus (OCA)
DCT, GPR143, LRMDA, MC1R, OCA2, SLC24A5, SLC45A2, TYR, TYR, TYRP1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
DCT, GPR143, LRMDA, MC1R, OCA2, SLC24A5, SLC45A2, TYR, TYRP1
HPO Terms
Generalized hypopigmentation, Hypopigmentation of skin, Hypopigmentation of hair, Ocular albinism, Reduced visual acuity, Nystagmus, Photophobia, Iris transillumination defect, Chorioretinal hypopigmentation, Hypoplasia of the fovea, Abnormal macular morphology, Retinal pigment epithelial mottling, Abnormality of retinal pigmentation, Optic nerve misrouting, Hypopigmentation of the fundus, Abnormal foveal morphology on macular OCT, Congenital onset, Abnormal iris pigmentation, Amblyopia
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