SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID300.00
Progressive externe Ophthalmoplegie mit mtDNA-Deletionen (PEOA, PEOB) : 10 Gene (17,868 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
DGUOK 617070 AR PEOB4 SNV und CNV: Short Read NGS
DNA2 615156 AD PEOA6 SNV und CNV: Short Read NGS
POLG 157640 AD PEOA1 SNV und CNV: Short Read NGS
POLG 258450 AR PEOB1 SNV und CNV: Short Read NGS
POLG2 610131 AD PEOA4 SNV und CNV: Short Read NGS
RNASEH1 616479 AR PEOB2 SNV und CNV: Short Read NGS
RRM2B 613077 AD PEOA5 SNV und CNV: Short Read NGS
SLC25A4 609283 AD PEOA2 SNV und CNV: Short Read NGS
TK2 617069 AR PEOB3 SNV und CNV: Short Read NGS
TOP3A 618098 AR PEOB5 SNV und CNV: Short Read NGS
TWNK 609286 AD PEOA3 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Progressive externe Ophthalmoplegie, autosomal-dominant (PEOA)
DNA2, POLG, POLG2, RRM2B, SLC25A4, TWNK
Progressive externe Ophthalmoplegie, autosomal-rezessiv (PEOB)
DGUOK, POLG, RNASEH1, TK2, TOP3A
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
DGUOK, DNA2, POLG, POLG2, RNASEH1, RRM2B, SLC25A4, TK2, TOP3A, TWNK
HPO Terms
Progressive external ophthalmoplegia, Ptosis, Ophthalmoplegia, Sensorineural hearing impairment, Muscle weakness, Myopathy, Ragged‑red fibers, Exercise intolerance, Elevated creatine kinase concentration, Cataract, Ataxia, Polyneuropathy, Myalgia, Elevated lactate concentration, Cerebellar atrophy, Vision loss, Peripheral neuropathy, Gait disturbance, Respiratory insufficiency due to muscle weakness, Axial muscle weakness
scroll to top