SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID034.01
Usher-Syndrom (USH) : 13 Gene (70,353 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ADGRV1 605472 AR USH2C SNV und CNV: Short Read NGS
ADGRV1 605472 DD; AR USH2C SNV und CNV: Short Read NGS
ADGRV1 605472 DD USH2C digenisch SNV und CNV: Short Read NGS
ARSG 618144 AR USH4 SNV und CNV: Short Read NGS
ARSG 618144 AR USH4 SNV und CNV: Short Read NGS
CDH23 601067 AR, DR USH1D, USH1D/F SNV und CNV: Short Read NGS
CDH23 601067 DR; AR USH1D SNV und CNV: Short Read NGS
CIB2 614869 AR USH1J SNV und CNV: Short Read NGS
CIB2 614869 AR USH1J SNV und CNV: Short Read NGS
CLRN1 276902 AR USH3A SNV und CNV: Short Read NGS
CLRN1 276902 AR USH3A SNV und CNV: Short Read NGS
HARS1 614504 AR USH3B SNV und CNV: Short Read NGS
HARS1 614504 AR USH3B SNV und CNV: Short Read NGS
MYO7A 276900 AR USH1B SNV und CNV: Short Read NGS
MYO7A 276900 AR USH1B SNV und CNV: Short Read NGS
PCDH15 602083 AR, DR USH1F, USH1D/F SNV und CNV: Short Read NGS
PCDH15 602083 DR; AR USH1F SNV und CNV: Short Read NGS
PDZD7 605472 DD; AR USH2C SNV und CNV: Short Read NGS
PDZD7 605472 DD USH2C digenisch SNV und CNV: Short Read NGS
USH1C 276904 AR USH1C SNV und CNV: Short Read NGS
USH1C 276904 AR USH1C SNV und CNV: Short Read NGS
USH1G 606943 AR USH1G SNV und CNV: Short Read NGS
USH1G 606943 AR USH1G SNV und CNV: Short Read NGS
USH2A 276901 AR USH2A SNV und CNV: Short Read NGS
USH2A 276901 AR USH2A SNV und CNV: Short Read NGS
WHRN 611383 AR USH2D SNV und CNV: Short Read NGS
WHRN 611383 AR USH2D SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Usher-Syndrom, Typ I (USH1)
CDH23, CIB2, MYO7A, PCDH15, USH1C, USH1G
Usher-Syndrom, Typ II (USH2)
ADGRV1, PDZD7, USH2A, WHRN
Usher-Syndrom, Typ III und Typ IV (USH3, USH4)
ARSG, CLRN1, HARS1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ADGRV1, ARSG, CDH23, CIB2, CLRN1, HARS1, MYO7A, PCDH15, PDZD7, USH1C, USH1G, USH2A, WHRN
HPO Terms
Prelingual sensorineural hearing impairment, Profound sensorineural hearing impairment, Progressive sensorineural hearing impairment, Progressive night blindness, Nyctalopia, Rod-cone dystrophy, Retinal degeneration, Visual loss, Reduced visual acuity, Photophobia, Horizontal nystagmus, Absent vestibular function, Vestibular hyporeflexia, Ataxia, Gait disturbance, Bilateral sensorineural hearing impairment, Vision impairment, Abnormal vestibular function, Abnormal electroretinogram, Bone spicule pigmentation of the retina
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