SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID178.00
Walker-Warburg-Syndrom (WWS, MDDGA) : 14 Gene (23,712 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
B3GALNT2 615181 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA11) SNV und CNV: Short Read NGS
B4GAT1 515287 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA13) SNV und CNV: Short Read NGS
CRPPA 614643 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA7) SNV und CNV: Short Read NGS
DAG1 616538 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA9) SNV und CNV: Short Read NGS
FKRP 613153 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA5) SNV und CNV: Short Read NGS
FKTN 253800 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA4) SNV und CNV: Short Read NGS
GMPPB 615350 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA14) SNV und CNV: Short Read NGS
LARGE1 613154 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA6) SNV und CNV: Short Read NGS
POMGNT1 253280 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA3) SNV und CNV: Short Read NGS
POMGNT2 614830 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA8) SNV und CNV: Short Read NGS
POMK 615249 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA12) SNV und CNV: Short Read NGS
POMT1 236670 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA1) SNV und CNV: Short Read NGS
POMT2 613150 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA2) SNV und CNV: Short Read NGS
RXYLT1 615041 AR Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA10) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Walker-Warburg-Syndrom (WWS, MDDGA)
B3GALNT2, B4GAT1, CRPPA, DAG1, FKRP, FKTN, GMPPB, LARGE1, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, RXYLT1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
B3GALNT2, B4GAT1, CRPPA, DAG1, FKRP, FKTN, GMPPB, LARGE1, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, RXYLT1
HPO Terms
Muscular hypotonia, Severe global developmental delay, Intellectual disability, Lissencephaly, Cerebellar hypoplasia, Hydrocephalus, Cerebral cortical dysplasia, Ventriculomegaly, Optic nerve hypoplasia, Retinal dystrophy, Coloboma, Cataract, Seizure, Hypertonia, Spasticity, Elevated creatine kinase, Muscle weakness, Abnormal ocular motility, Developmental delay, Contractures
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