SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID109.03
Cutis laxa (ARCL, ADCL) : 13 Gene (32,096 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ALDH18A1 219150 AR Cutis laxa (ARCL3A) SNV und CNV: Short Read NGS
ALDH18A1 616603 AD Cutis laxa (ADCL3) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP6V0A2 219200 AR Cutis laxa (ARCL2A) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP6V1A 617403 AR Cutis laxa (ARCL2D) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP6V1E1 617402 AR Cutis laxa (ARCL2C) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP7A 304150 XLR Cutis laxa (OHS) SNV und CNV: Short Read NGS
EFEMP1 620780 AR Cutis laxa (ARCL1D) SNV und CNV: Short Read NGS
EFEMP2 614437 AR Cutis laxa (ARCL1B) SNV und CNV: Short Read NGS
ELN 123700 AD Cutis laxa (ADCL1) SNV und CNV: Short Read NGS
FBLN5 219100 AR Cutis laxa (ARCL1A) SNV und CNV: Short Read NGS
FBLN5 614434 AD Cutis laxa (ADCL2) SNV und CNV: Short Read NGS
LTBP1 619451 AR Cutis laxa (ARCL2E) SNV und CNV: Short Read NGS
LTBP4 613177 AR Cutis laxa (ARCL1C) SNV und CNV: Short Read NGS
PYCR1 612940 AR Cutis laxa (ARCL2B) SNV und CNV: Short Read NGS
PYCR1 614438 AR Cutis laxa (ARCL3B) SNV und CNV: Short Read NGS
RIN2 613075 AR Cutis laxa (MACS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Cutis laxa (ARCL, ADCL)
ALDH18A1, ALDH18A1, ATP6V0A2, ATP6V1A, ATP6V1E1, ATP7A, EFEMP1, EFEMP2, ELN, FBLN5, FBLN5, LTBP1, LTBP4, PYCR1, PYCR1, RIN2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ALDH18A1, ATP6V0A2, ATP6V1A, ATP6V1E1, ATP7A, EFEMP1, EFEMP2, ELN, FBLN5, LTBP1, LTBP4, PYCR1, RIN2
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