SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID299.01
Großwuchs, umfassende Diagnostik : 64 Gene (211,347 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 4 - 6 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
ABCC9
AKT1
AKT2
AKT3
ASPA
ASXL2
BRWD3
CCND2
CDKN1C
CHD8
CUL4B
DICER1
DIS3L2
DNMT3A
EED
EZH2
FBN1
FIBP
GFAP
GLI3
GPC3
GPC4
GRIA3
H1-4
HEPACAM
HERC1
HUWE1
KIF7
KPTN
L1CAM
MED12
MLC1
MPDZ
MTOR
NFIX
NONO
NPR2
NSD1
OFD1
PDGFRB
PHF21A
PIGA
PIK3CA
PIK3R2
PPP2R5C
PPP2R5D
PTCH1
PTEN
RAB39B
RNF125
RNF135
SETD2
SHANK3
STRADA
SUFU
SUZ12
SYN1
TBC1D7
TCF20
TMEM94
TRIP12
UPF3B
ZBTB20
ZDHHC9
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCC9, AKT1, AKT2, AKT3, ASPA, ASXL2, BRWD3, CCND2, CDKN1C, CHD8, CUL4B, DICER1, DIS3L2, DNMT3A, EED, EZH2, FBN1, FIBP, GFAP, GLI3, GPC3, GPC4, GRIA3, H1-4, HEPACAM, HERC1, HUWE1, KIF7, KPTN, L1CAM, MED12, MLC1, MPDZ, MTOR, NFIX, NONO, NPR2, NSD1, OFD1, PDGFRB, PHF21A, PIGA, PIK3CA, PIK3R2, PPP2R5C, PPP2R5D, PTCH1, PTEN, RAB39B, RNF125, RNF135, SETD2, SHANK3, STRADA, SUFU, SUZ12, SYN1, TBC1D7, TCF20, TMEM94, TRIP12, UPF3B, ZBTB20, ZDHHC9
HPO Terms
Tall stature, Macrocephaly, Large head circumference, Hypertelorism, Prominent forehead, Macroglossia, Overgrowth, Large ears, Large mandible, Hypertrophy of lower limb, Hypertrophy of upper limb, Increased body weight, Large palm, Facial asymmetry, Macrodactyly, Growth hormone excess, Excessive growth hormone secretion, Large nose, Developmental delay
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