SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID125.01
Rett-Syndrom (RTT) und ähnliche Krankheitsbilder : 16 Gene (45,966 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
CDKL5 300672 XLD Frühinfantile epileptische Enzephalopathie (EIEE2) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXG1 613454 AD Rett-Syndrom, kongenitale Variante SNV und CNV: Short Read NGS
GABBR2 617903 AD Neurologische Entwicklungsstörung (NDPLHS) SNV und CNV: Short Read NGS
GABRA2 618557 AD Frühinfantile epileptische Enzephalopathie (EIEE78) SNV und CNV: Short Read NGS
GABRB2 617829 AD Frühinfantile epileptische Enzephalopathie (IECEE2), SNV und CNV: Short Read NGS
GRIN2B 613970 AD Mentale Retardierung (MRD6) SNV und CNV: Short Read NGS
HTT 617435 AR Lopes-Maciel-Rodan-Syndrom (LOMARS) SNV und CNV: Short Read NGS
IQSEC2 309530 XLD Mentale Retardierung (MRX1) SNV und CNV: Short Read NGS
MECP2 312750 XLD Rett-Syndrom (RTT) SNV und CNV: Short Read NGS
MECP2 312750 XLD Rett-Syndrom, Zappela-Variante SNV und CNV: Short Read NGS
MEF2C 613443 AD Mentale Retardierung (MRD20) SNV und CNV: Short Read NGS
NTNG2 618718 AR Neurologische Entwicklungsstörung (NEDBASH) SNV und CNV: Short Read NGS
SHANK3 606232 AD Phelan-McDermid-Syndrom (PHMDS) SNV und CNV: Short Read NGS
STXBP1 612164 AD Frühinfantile epileptische Enzephalopathie (EIEE4) SNV und CNV: Short Read NGS
TCF4 610954 AD Pitt-Hopkins-Syndrom (PTHS) SNV und CNV: Short Read NGS
UBE3A 105830 AD Angelman-Syndrom (AS) SNV und CNV: Short Read NGS
WDR45 300894 XLD Enzephalopathie und Neurodegeneration (SENDAI) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Rett-Syndrom (RTT) und ähnliche Krankheitsbilder
CDKL5, FOXG1, GABBR2, GABRA2, GABRB2, GRIN2B, HTT, IQSEC2, MECP2, MECP2, MEF2C, NTNG2, SHANK3, STXBP1, TCF4, UBE3A, WDR45
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CDKL5, FOXG1, GABBR2, GABRA2, GABRB2, GRIN2B, HTT, IQSEC2, MECP2, MEF2C, NTNG2, SHANK3, STXBP1, TCF4, UBE3A, WDR45
HPO Terms
Developmental regression, Hand stereotypies, Microcephaly, Seizure, Intellectual disability, Gait ataxia, Scoliosis, Visual impairment, Constipation, Feeding difficulties, Growth retardation, Autonomic dysfunction, Hand clapping, Hand wringing, Speech impairment, Breathing irregularities, Loss of hand skills, Hypotonia, Hyperreflexia, Loss of fine motor skills
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