SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID391.01
Azoospermie und Kryptozoospermie : 60 Gene (142,020 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 4 - 6 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ADAD2 C14ORF39 AR CATIP SNV und CNV: Short Read NGS
CATSPER1 CT55 CLDN2 CYLC1 SNV und CNV: Short Read NGS
DDX3Y FANCM DMRT1 FKBP6 SNV und CNV: Short Read NGS
GCNA KCTD19 KASH5 KLHL10 SNV und CNV: Short Read NGS
M1AP MCMDC2 MCM9 MEI1 SNV und CNV: Short Read NGS
MEIOB MSH4 MOV10L1 MSH5 SNV und CNV: Short Read NGS
NANOS1 PMFBP1 PDHA2 PNLDC1 SNV und CNV: Short Read NGS
RAD21L1 RPL10L RNF212 SHOC1 SNV und CNV: Short Read NGS
SOHLH1 SPO11 SPINK2 STAG3 SNV und CNV: Short Read NGS
STRA8 SYCP3 SYCP2 TAF4B SNV und CNV: Short Read NGS
TDRD9 TEX11 TERB2 TEX14 SNV und CNV: Short Read NGS
TEX15 ZMYND15 XRCC2 ZSWIM7 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Azoospermie und Kryptozoospermie
ADAD2, CATSPER1, DDX3Y, GCNA, M1AP, MEIOB, NANOS1, RAD21L1, SOHLH1, STRA8, TDRD9, TEX15
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ADAD2, ADGRG2, AR, C14orf39, CATIP, CATSPER1, CFTR, CLDN2, CT55, CYLC1, DDX3Y, DMC1, DMRT1, FANCM, FKBP6, GCNA, HFM1, KASH5, KCTD19, KLHL10, M1AP, MCM8, MCM9, MCMDC2, MEI1, MEIOB, MLH3, MOV10L1, MSH4, MSH5, NANOS1, NR5A1, PDHA2, PMFBP1, PNLDC1, RAD21L1, RBBP7, RNF212, RPL10L, SHOC1, SOHLH1, SPATA22, SPINK2, SPO11, STAG3, STRA8, SYCE1, SYCP2, SYCP3, TAF4B, TDRD9, TERB1, TERB2, TEX11, TEX14, TEX15, USP9Y, XRCC2, ZMYND15, ZSWIM7
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