SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID024.02
Hypercholesterinämie : 13 Gene (36,390 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ABCG5 618666 AR Sitosterolämie (STSL2) SNV und CNV: Short Read NGS
ABCG8 210250 AR Sitosterolämie (STSL1) SNV und CNV: Short Read NGS
APOB 144010 AD Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL2) SNV und CNV: Short Read NGS
APOE 617347 AR, AD Hypercholesterinämie (LDLCQ5) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP7A1 118455 AR Hypercholesterinämie (LDLCQ) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP27A1 213700 AR Zerebrale Cholesterinose (CTX) SNV und CNV: Short Read NGS
LDLR 143890 AD, AR Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL1) SNV und CNV: Short Read NGS
LDLRAP1 603813 AR Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL4) SNV und CNV: Short Read NGS
LIPA 278000 AR Cholesterinester-Speicherkrankheit (CESD) SNV und CNV: Short Read NGS
NPC1L1 617966 AR Hypercholesterinämie (LDLCQ7) SNV und CNV: Short Read NGS
PCSK9 603776 AD Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL3) SNV und CNV: Short Read NGS
PNPLA5 611589 AR Hypercholesterinämie (LDLCQ) SNV und CNV: Short Read NGS
SORT1 613589 AD Hypercholesterinämie (LDLCQ6) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hypercholesterinämie
ABCG5, ABCG8, APOB, APOE, CYP27A1, CYP7A1, LDLR, LDLRAP1, LIPA, NPC1L1, PCSK9, PNPLA5, SORT1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCG5, ABCG8, APOB, APOE, CYP27A1, CYP7A1, LDLR, LDLRAP1, LIPA, NPC1L1, PCSK9, PNPLA5, SORT1
HPO Terms
Hypercholesterolemia, Increased LDL cholesterol concentration, Abnormal LDL cholesterol concentration, Xanthomatosis, Tendon xanthomatosis, Xanthelasma, Coronary artery atherosclerosis, Atherosclerosis, Premature atherosclerosis, Arteriosclerosis, Hypertriglyceridemia, Elevated circulating sitosterol concentration, Hyperlipidemia, Aortic atherosclerotic lesion, Carotid artery stenosis, Peripheral arterial stenosis, Coronary artery aneurysm, Hypercholesterinämie, Elevated circulating cholesterol concentration, Abnormal circulating cholesterol concentration
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