SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID025.06
Hypercholesterinämie : 13 Gene (36,390 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ABCG5 618666 AR Sitosterolämie (STSL2) SNV und CNV: Short Read NGS
ABCG8 210250 AR Sitosterolämie (STSL1) SNV und CNV: Short Read NGS
AGPAT2 608594 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL1) SNV und CNV: Short Read NGS
AKT2 240900 AD Lipodystrophie (HIHGHH) SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPTL3 605019 AD Hypotriglyzeridämie (TGQTL) SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPTL4 615881 AD Hypotriglyzeridämie (TGQTL) SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPTL8 616223 AD Hypotriglyzeridämie (TGQTL) SNV und CNV: Short Read NGS
APOA5 144650 AD Hyperlipoproteinämie, Typ V SNV und CNV: Short Read NGS
APOA5 145750 AD Hypertriglyzeridämie (HYTG1) SNV und CNV: Short Read NGS
APOB 144010 AD Hyperlipoproteinämie, Typ IIB SNV und CNV: Short Read NGS
APOB 144010 AD Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL2) SNV und CNV: Short Read NGS
APOC2 207750 AR Hyperlipoproteinämie, Typ IB SNV und CNV: Short Read NGS
APOC3 614028 AD Apolipoprotein-C-III-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
APOE 617347 AR, AD Hyperlipoproteinämie, Typ III SNV und CNV: Short Read NGS
APOE 617347 AR, AD Hypercholesterinämie (LDLCQ5) SNV und CNV: Short Read NGS
BSCL2 269700 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL2) SNV und CNV: Short Read NGS
CAV1 612526 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL3) SNV und CNV: Short Read NGS
CAV1 606721 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD7) SNV und CNV: Short Read NGS
CAVIN1 613327 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL4) SNV und CNV: Short Read NGS
CIDEC 615238 AR Partielle Lipodystrophie (FPLD5) SNV und CNV: Short Read NGS
CREB3L3 619324 AD Hypertriglyzeridämie (HYTG2) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP7A1 118455 AR Hypercholesterinämie (LDLCQ) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP27A1 213700 AR Zerebrale Cholesterinose (CTX) SNV und CNV: Short Read NGS
GCKR 613463 AD Hypertriglyzeridämie (FGQTL5) SNV und CNV: Short Read NGS
GK 307030 XLR Glycerinkinase-Mangel (GKD) SNV und CNV: Short Read NGS
GPD1 614480 AR Hypertriglyzeridämie (HTGTI) SNV und CNV: Short Read NGS
GPIHBP1 615947 AR Hyperlipoproteinämie, Typ ID SNV und CNV: Short Read NGS
LDLR 143890 AD, AR Hyperlipoproteinämie, Typ II SNV und CNV: Short Read NGS
LDLR 143890 AD, AR Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL1) SNV und CNV: Short Read NGS
LDLRAP1 603813 AR Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL4) SNV und CNV: Short Read NGS
LIPA 278000 AR Cholesterinester-Speicherkrankheit (CESD) SNV und CNV: Short Read NGS
LIPC 614025 AR Hepatischer Lipase-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
LIPE 615980 AR Partielle Lipodystrophie (FPLD6) SNV und CNV: Short Read NGS
LIPG 603684 AD Lipase-Aktivitätsmangel SNV und CNV: Short Read NGS
LMF1 246650 AR Kombinierter Lipasemangel SNV und CNV: Short Read NGS
LMNA 151660 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD2) SNV und CNV: Short Read NGS
LPL 238600 AR Hyperlipoproteinämie, Typ IA SNV und CNV: Short Read NGS
NPC1L1 617966 AR Hypercholesterinämie (LDLCQ7) SNV und CNV: Short Read NGS
PCSK9 603776 AD Familiäre Hypercholesterinämie (FHCL3) SNV und CNV: Short Read NGS
PLIN1 613877 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD4) SNV und CNV: Short Read NGS
PNPLA5 611589 AR Hypercholesterinämie (LDLCQ) SNV und CNV: Short Read NGS
POLD1 615381 AD Lipodystrophie (MDPL) SNV und CNV: Short Read NGS
PPARG 604367 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD3) SNV und CNV: Short Read NGS
SORT1 613589 AD Hypercholesterinämie (LDLCQ6) SNV und CNV: Short Read NGS
ZMPSTE24 608612 AR Lipodystrophie (MADB) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hypertriglyzeridämie
AGPAT2, AKT2, ANGPTL3, ANGPTL4, ANGPTL8, APOA5, APOB, APOC2, APOC3, APOE, BSCL2, CAV1, CAVIN1, CIDEC, CREB3L3, GCKR, GK, GPD1, GPIHBP1, LIPC, LIPE, LIPG, LMF1, LMNA, LPL, PLIN1, POLD1, PPARG, ZMPSTE24
Hypercholesterinämie
ABCG5, ABCG8, APOB, APOE, CYP27A1, CYP7A1, LDLR, LDLRAP1, LIPA, NPC1L1, PCSK9, PNPLA5, SORT1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCG5, ABCG8, APOB, APOE, CYP27A1, CYP7A1, LDLR, LDLRAP1, LIPA, NPC1L1, PCSK9, PNPLA5, SORT1
HPO Terms
Hyperlipidemia, Hypercholesterolemia, Hypertriglyceridemia, Increased LDL cholesterol concentration, Increased VLDL cholesterol concentration, Xanthomatosis, Tendon xanthomatosis, Corneal arcus, Atherosclerosis, Premature atherosclerosis, Coronary artery disease, Coronary artery aneurysm, Hypertension, Hyperlipoproteinemia, Xanthomas, Xanthomas of the palmar creases, Elevated circulating apolipoprotein B concentration, Elevated circulating apolipoprotein A-II concentration, Eruptive xanthoma, Elevated circulating LDL cholesterol concentration
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