SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID055.04
Lipodystrophie (CGL, FPLD) : 15 Gene (21,963 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ADRA2A 620679 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD8) SNV und CNV: Short Read NGS
AGPAT2 608594 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL1) SNV und CNV: Short Read NGS
AKT2 240900 AD Lipodystrophie (HIHGHH) SNV und CNV: Short Read NGS
BSCL2 269700 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL2) SNV und CNV: Short Read NGS
CAV1 612526 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL3) SNV und CNV: Short Read NGS
CAV1 606721 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD7) SNV und CNV: Short Read NGS
CAVIN1 613327 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL4) SNV und CNV: Short Read NGS
CIDEC 615238 AR Partielle Lipodystrophie (FPLD5) SNV und CNV: Short Read NGS
LIPE 615980 AR Partielle Lipodystrophie (FPLD6) SNV und CNV: Short Read NGS
LMNA 151660 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD2) SNV und CNV: Short Read NGS
PCYT1A 620680 AR Generalisierte Lipodystrophie (CGL5) SNV und CNV: Short Read NGS
PLAAT3 620683 AR Partielle Lipodystrophie (FPLD9) SNV und CNV: Short Read NGS
PLIN1 613877 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD4) SNV und CNV: Short Read NGS
POLD1 615381 AD Lipodystrophie (MDPL) SNV und CNV: Short Read NGS
PPARG 604367 AD Partielle Lipodystrophie (FPLD3) SNV und CNV: Short Read NGS
ZMPSTE24 608612 AR Lipodystrophie (MADB) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kongenitale generalisierte Lipodystrophie (CGL)
AGPAT2, BSCL2, CAV1, CAVIN1, PCYT1A
Familiäre partielle Lipodystrophie (FPLD)
ADRA2A, CAV1, CIDEC, LIPE, LMNA, PLAAT3, PLIN1, PPARG
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ADRA2A, AGPAT2, AKT2, BSCL2, CAV1, CAVIN1, CIDEC, LIPE, LMNA, PCYT1A, PLAAT3, PLIN1, POLD1, PPARG, ZMPSTE24
HPO Terms
Lipodystrophy, Reduced subcutaneous adipose tissue, Reduced intraabdominal adipose tissue, Reduced intrathoracic adipose tissue, Loss of facial adipose tissue, Hypertriglyceridemia, Hyperuricemia, Hepatic steatosis, Diabetes mellitus, Hyperglycemia, Hyperinsulinemia, Acanthosis nigricans, Hepatomegaly, Hypertension, Hypercholesterolemia, Gout, Decreased circulating leptin, Decreased adiponectin level, Insulin resistance, Polyphagia
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