SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID177.01
Morbus Hirschsprung (HSCR) : 20 Gene (37,134 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
DNMT3B 602900 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
ECE1 613870 AD HCAD-Syndrom (HCAD) SNV und CNV: Short Read NGS
EDN3 613712 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR4) SNV und CNV: Short Read NGS
EDNRB 600155 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR2) SNV und CNV: Short Read NGS
GDNF 613711 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR3) SNV und CNV: Short Read NGS
GFRA1 601436 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
KIFBP 609460 AR Goldberg-Shprintzen-Syndrom (GOSHS) SNV und CNV: Short Read NGS
L1CAM 307000 XLR Hydrozephalus mit HSCR (HSAS) SNV und CNV: Short Read NGS
NRG1 142445 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
NRTN 608018 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
NTF3 162660 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
NTRK3 191316 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
PHOX2B 209880 AD Haddad-Syndrom (OHD) SNV und CNV: Short Read NGS
PHOX2B 613013 AD Neuroblastom mit HSCR (NBLST2) SNV und CNV: Short Read NGS
PSPN 602921 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
RET 142623 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR1) SNV und CNV: Short Read NGS
SEMA3A 603961 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
SEMA3C 602645 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
SEMA3D 609907 AD Hirschsprung-Krankheit (HSCR) SNV und CNV: Short Read NGS
SOX10 609136 AD PCWH-Syndrom (PWCH) SNV und CNV: Short Read NGS
ZEB2 235730 AD Mowat-Wilson-Syndrom (MOWS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Morbus Hirschsprung (HSCR)
DNMT3B, ECE1, EDN3, EDNRB, GDNF, GFRA1, KIFBP, L1CAM, NRG1, NRTN, NTF3, NTRK3, PHOX2B, PHOX2B, PSPN, RET, SEMA3A, SEMA3C, SEMA3D, SOX10, ZEB2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
DNMT3B, ECE1, EDN3, EDNRB, GDNF, GFRA1, KIFBP, L1CAM, NRG1, NRTN, NTF3, NTRK3, PHOX2B, PSPN, RET, SEMA3A, SEMA3C, SEMA3D, SOX10, ZEB2
HPO Terms
Hirschsprung disease, Abdominal distention, Delayed passage of meconium, Constipation, Enterocolitis, Abdominal pain, Vomiting, Failure to thrive, Feeding difficulties, Intestinal obstruction, Polyhydramnios, Anal atresia, Congenital megacolon, Atrial septal defect, Renal agenesis, Neurodevelopmental delay, Hypotonia, Abnormality of intestinal innervation, Hypospadias
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