SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID141.02
Pankreatitis (PCTT) : 18 Gene (29,559 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
APOA5 145750 AD Hypertriglyzeridämie SNV und CNV: Short Read NGS
APOC2 207750 AR Hyperlipoproteinämie, Typ IB SNV und CNV: Short Read NGS
CASR 239200 AR Hyperparathyroidismus (NSHPT) SNV und CNV: Short Read NGS
CEL 609812 AD Diabetes-Pankreas-Dysfunktionssyndrom (MODY8) SNV und CNV: Short Read NGS
CELA3B 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
CFTR 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
CLDN2 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
CPA1 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
CTRC 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
CTSB 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
GPIHBP1 615947 AR Hyperlipoproteinämie, Typ ID SNV und CNV: Short Read NGS
LMF1 246650 AR Hypertriglyzeridämie SNV und CNV: Short Read NGS
LPL 238600 AR Hyperlipoproteinämie, Typ IA SNV und CNV: Short Read NGS
PNLIP 614338 AR Pankreaslipase-Mangel (PLIPD) SNV und CNV: Short Read NGS
PRSS1 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
SPINK1 167800 AD PCTT SNV und CNV: Short Read NGS
TRPV6 618188 AR Hyperparathyroidismus (HRPTTN) SNV und CNV: Short Read NGS
UBR1 243800 AR Johanson-Blizzard-Syndrom (JBS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Pankreatitis (PCTT)
APOA5, APOC2, CASR, CEL, CELA3B, CFTR, CLDN2, CPA1, CTRC, CTSB, GPIHBP1, LMF1, LPL, PNLIP, PRSS1, SPINK1, TRPV6, UBR1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
APOA5, APOC2, CASR, CEL, CELA3B, CFTR, CLDN2, CPA1, CTRC, CTSB, GPIHBP1, LMF1, LPL, PNLIP, PRSS1, SPINK1, TRPV6, UBR1
HPO Terms
Pancreatitis, Acute pancreatitis, Recurrent pancreatitis, Chronic pancreatitis, Chronic calcifying pancreatitis, Pancreatic pseudocyst, Pancreatic calcification, Exocrine pancreatic insufficiency, Hypertriglyceridemia, Hyperlipidemia, Hyperlipoproteinemia, Hypercholesterolemia, Diabetes mellitus, Type II diabetes mellitus, Hyperglycemia, Abdominal pain, Nausea, Vomiting, Steatorrhea, Fat malabsorption
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