SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID305.02
Polyzystische Lebererkrankung (PCLD) : 16 Gene (55,740 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ALG5 620056 AD Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD7) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG6 603147 AR Polyzystische Lebererkrankung (PCLD) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG8 617874 AD Polyzystische Lebererkrankung (PCLD3) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG9 263210 AR Polyzystische Lebererkrankung (PCLD) SNV und CNV: Short Read NGS
DNAJB11 618061 AD Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD6) SNV und CNV: Short Read NGS
DZIP1L 617610 AR Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD5) SNV und CNV: Short Read NGS
GANAB 600666 AD Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD3) SNV und CNV: Short Read NGS
IFT140 266920 AD Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD) SNV und CNV: Short Read NGS
LRP5 617875 AD Polyzystische Lebererkrankung (PCLD4) SNV und CNV: Short Read NGS
NEK8 609799 AD Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD8) SNV und CNV: Short Read NGS
PKD1 173900 AD Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD1) SNV und CNV: Short Read NGS
PKD2 613095 AD Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD2) SNV und CNV: Short Read NGS
PKHD1 263200 AR Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD4) SNV und CNV: Short Read NGS
PRKCSH 174050 AD Polyzystische Lebererkrankung (PCLD1) SNV und CNV: Short Read NGS
SEC61B 174050 AD Polyzystische Lebererkrankung (PCLD) SNV und CNV: Short Read NGS
SEC63 617004 AD Polyzystische Lebererkrankung (PCLD2) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Polyzystische Lebererkrankung mit oder ohne Nierenzysten (PCLD)
ALG6, ALG8, ALG9, LRP5, PRKCSH, SEC61B, SEC63
Polyzystische Nierenerkrankung mit polyzystischer Lebererkrankung (PKD)
ALG5, DNAJB11, DZIP1L, GANAB, IFT140, NEK8, PKD1, PKD2, PKHD1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ALG5, ALG6, ALG8, ALG9, DNAJB11, DZIP1L, GANAB, IFT140, LRP5, NEK8, PKD1, PKD2, PKHD1, PRKCSH, SEC61B, SEC63
HPO Terms
Polycystic liver disease, Hepatic cysts, Hepatomegaly, Abdominal distention, Ascites, Portal hypertension, Hepatic fibrosis, Autosomal dominant inheritance, Renal cyst, Multiple renal cysts, Polycystic kidney dysplasia, Chronic kidney disease, Renal insufficiency, Renal interstitial fibrosis, Renal cortical microcysts, Renal atrophy, Renal dysplasia, Hypertension, Elevated circulating creatinine concentration, Reduced glomerular filtration rate
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