SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID271.02
Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM) : 15 Gene (51,954 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ADGRG1 606854 AR Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM14A) SNV und CNV: Short Read NGS
ADGRG1 615752 AR Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM14B) SNV und CNV: Short Read NGS
APC2 618677 AR Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM10) SNV und CNV: Short Read NGS
CAMSAP1 620316 AR Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM12) SNV und CNV: Short Read NGS
CTNNA2 618174 AR Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM9) SNV und CNV: Short Read NGS
DYNC1H1 614563 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM13) SNV und CNV: Short Read NGS
KIF2A 615411 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM3) SNV und CNV: Short Read NGS
KIF5C 615282 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM2) SNV und CNV: Short Read NGS
KIF26A 620156 AR Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM11) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBA1A 611603 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM, LIS3) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB 615771 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM6) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB2A 615763 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM5) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB2B 610031 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM7) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB3 614039 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM1) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBG1 615412 AD Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM4) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBGCP2 618737 AR Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM15) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Komplexe kortikale Dysplasie mit weiteren Hirnfehlbildungen (CDCBM)
ADGRG1, ADGRG1, APC2, CAMSAP1, CTNNA2, DYNC1H1, KIF26A, KIF2A, KIF5C, TUBA1A, TUBB, TUBB2A, TUBB2B, TUBB3, TUBG1, TUBGCP2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ADGRG1, APC2, CAMSAP1, CTNNA2, DYNC1H1, KIF26A, KIF2A, KIF5C, TUBA1A, TUBB, TUBB2A, TUBB2B, TUBB3, TUBG1, TUBGCP2
HPO Terms
Seizure, Infantile spasms, Hypsarrhythmia, Hypotonia, Hypertonia, Spasticity, Global developmental delay, Intellectual disability, Dysarthria, Speech delay, Motor delay, Cerebellar hypoplasia, Polymicrogyria, Lissencephaly, Pachygyria, Periventricular heterotopia, Corpus callosum hypoplasia, Ventriculomegaly, Hydrocephalus, Microcephaly
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