SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID289.00
Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS) : 11 Gene (22,644 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AP3B1 608233 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS2) SNV und CNV: Short Read NGS
AP3D1 617050 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS10) SNV und CNV: Short Read NGS
BLOC1S3 614077 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS8) SNV und CNV: Short Read NGS
BLOC1S5 619172 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS11) SNV und CNV: Short Read NGS
BLOC1S6 614171 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS9) SNV und CNV: Short Read NGS
DTNBP1 614076 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS7) SNV und CNV: Short Read NGS
HPS1 203300 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS1) SNV und CNV: Short Read NGS
HPS3 614072 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS3) SNV und CNV: Short Read NGS
HPS4 614073 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS4) SNV und CNV: Short Read NGS
HPS5 614074 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS5) SNV und CNV: Short Read NGS
HPS6 614075 AR Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS6) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hermansky-Pudlak-Syndrom (HPS)
AP3B1, AP3D1, BLOC1S3, BLOC1S5, BLOC1S6, DTNBP1, HPS1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AP3B1, AP3D1, BLOC1S3, BLOC1S5, BLOC1S6, DTNBP1, HPS1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6
HPO Terms
Ocular albinism, Generalized hypopigmentation, Reduced visual acuity, Photophobia, Nystagmus, Reduced platelet dense granules, Impaired ADP-induced platelet aggregation, Impaired collagen-induced platelet aggregation, Prolonged bleeding time, Epistaxis, Gingival bleeding, Excessive bleeding after venipuncture, Immunodeficiency, Recurrent bacterial infections, Recurrent abscess formation, Pulmonary fibrosis, Colitis, Recurrent respiratory infections, Reduced natural killer cell activity, Recurrent urinary tract infections
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