SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID217.01
Ichthyose : 38 Gene (72,519 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ABCA12 601277 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI4A) SNV und CNV: Short Read NGS
ABCA12 242500 AR Kongenitale Ichthyose (Harlekin, ARCI4B) SNV und CNV: Short Read NGS
ABHD5 275630 AR Chanarin-Dorfman-Syndrom (CDS) SNV und CNV: Short Read NGS
ALDH3A2 270200 AR Sjögren-Larsson-Syndrom (SLS) SNV und CNV: Short Read NGS
ALOX12B 242100 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI2) SNV und CNV: Short Read NGS
ALOXE3 606545 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI3) SNV und CNV: Short Read NGS
AP1B1 242150 AR KID-Syndrom (KIDAR) SNV und CNV: Short Read NGS
AP1S1 609313 AR Ichthyose-Syndrom (MEDNIK) SNV und CNV: Short Read NGS
ASPRV1 146750 AD Lamellare Ichthyose (ADLI) SNV und CNV: Short Read NGS
CASP14 617320 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI12) SNV und CNV: Short Read NGS
CERS3 615023 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI9) SNV und CNV: Short Read NGS
CLDN1 607626 AR NISCH-Syndrom (ILVASC) SNV und CNV: Short Read NGS
CLDN10 617671 AR HELIX-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
CSTA 607936 AR Ichthyosis bullosa, Siemens-ähnlicher-Typ (PSS4) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP4F22 604777 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI5) SNV und CNV: Short Read NGS
ELOVL4 614457 AR Ichthyose-Syndrom (ISQMR) SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC2 601675 AR Ichthyose-Syndrom (TTD1) SNV und CNV: Short Read NGS
FLG 146700 AD Ichthyosis vulgaris (ADI) SNV und CNV: Short Read NGS
GJB2 602540 AD Ichthyosis hystrix mit Taubheit (HID) SNV und CNV: Short Read NGS
GJB2 148210 AD KID-Syndrom (KIDAD) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT1 113800 AD Epidermolytische Ichthyose (EHK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT1 607602 AD Zyklische epidermolytische Ichthyose (CIEHK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT1 146590 AD Ichthyosis hystrix, Curth-Macklin-Typ (IHCM) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT2 146800 AD Ichthyosis bullosa, Siemens-Typ (IBS) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT10 609165 AD Ichthyosis variegata (CRIE) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT10 113800 AD Epidermolytische Ichthyose (EHK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT10 607602 AD Zyklische epidermolytische Ichthyose (CIEHK) SNV und CNV: Short Read NGS
LIPN 613943 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI8) SNV und CNV: Short Read NGS
LORICRIN 152445 AD Vohwinkel-Syndrom, Variante SNV und CNV: Short Read NGS
MBTPS2 308205 XLR IFAP-Syndrom (IFAP1) SNV und CNV: Short Read NGS
NIPAL4 612281 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI6) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX7 614879 AR Adultes Refsum-Syndrom 2 SNV und CNV: Short Read NGS
PHYH 266500 AR Adultes Refsum-Syndrom 1 SNV und CNV: Short Read NGS
PNPLA1 615024 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI10) SNV und CNV: Short Read NGS
POMP 601952 AR KLICK-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
SDR9C7 617574 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI13) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC27A4 608649 AR Ichthyose-Frühgeburt-Syndrom (IPS) SNV und CNV: Short Read NGS
SNAP29 609528 AR CEDNIK-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
SPINK5 256500 AR Netherton-Syndrom (NETH) SNV und CNV: Short Read NGS
SREBF1 619016 AD IFAP-Syndrom (IFAP2) SNV und CNV: Short Read NGS
ST14 602400 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI11) SNV und CNV: Short Read NGS
STS 308100 XLR Ichthyose, X-chromosomal (XLI) SNV und CNV: Short Read NGS
SULT2B1 617571 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI14) SNV und CNV: Short Read NGS
TGM1 242300 AR Kongenitale Ichthyose (ARCI1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kongenitale Ichthyose, autosomal-rezessiv (ARCI)
ABCA12, ALOX12B, ALOXE3, CASP14, CERS3, CYP4F22, LIPN, NIPAL4, PNPLA1, SDR9C7, SLC27A4, ST14, SULT2B1, TGM1
Ichthyose, autosomal-dominant und X-chromosomal
ASPRV1, FLG, GJB2, KRT1, KRT10, KRT2, STS
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCA12, ABHD5, ALDH3A2, ALOX12B, ALOXE3, AP1B1, AP1S1, ASPRV1, CASP14, CERS3, CLDN1, CLDN10, CSTA, CYP4F22, ELOVL4, ERCC2, FLG, GJB2, KRT1, KRT10, KRT2, LIPN, LORICRIN, MBTPS2, NIPAL4, PEX7, PHYH, PNPLA1, POMP, SDR9C7, SLC27A4, SNAP29, SPINK5, SREBF1, ST14, STS, SULT2B1, TGM1
HPO Terms
Ichthyosis, Hyperkeratosis, Scaling skin, Dry skin, Erythroderma, Palmoplantar keratoderma, Palmoplantar hyperkeratosis, Palmoplantar scaling skin, Sparse hair, Anhidrosis, Hypohidrosis, Hyperkeratotic papule, Congenital ichthyosiform erythroderma, Ichthyosis vulgaris, Abnormal nail morphology, Hyperhidrosis, Excessive wrinkling of palmar skin, Nail dystrophy, Palmoplantar hyperlinearity
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