SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID323.00
Palmoplantarkeratose (PPK) : 33 Gene (58,167 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AAGAB 148600 AD Palmoplantarkeratose, punktierter Typ (PPKP1A) SNV und CNV: Short Read NGS
AQP5 600231 AD Palmoplantarkeratose, Bothnian-Typ (PPKB) SNV und CNV: Short Read NGS
CTSC 245000 AR Papillon-Lefevre-Syndrom (PALS) SNV und CNV: Short Read NGS
DSG1 148700 AD Keratosis palmoplantaris striata (PPKS1) SNV und CNV: Short Read NGS
DSP 612908 AD Keratosis palmoplantaris striata (PPKS2) SNV und CNV: Short Read NGS
ENPP1 615522 AD Cole-Syndrom (COLED) SNV und CNV: Short Read NGS
GJA1 617525 AD Erythrokeratodermia variabilis et progressive (EKVP3) SNV und CNV: Short Read NGS
GJA1 104100 AD Palmoplantarkeratose und kongenitale Alopezie (PPKCA1) SNV und CNV: Short Read NGS
GJB2 148350 AD Palmoplantarkeratose mit Taubheit SNV und CNV: Short Read NGS
GJB2 124500 AD Vohwinkel-Syndrom (VOWNKL) SNV und CNV: Short Read NGS
GJB3 133200 AD, AR Erythrokeratodermia variabilis et progressive (EKVP1) SNV und CNV: Short Read NGS
GJB4 617524 AD Erythrokeratodermia variabilis et progressive (EKVP2) SNV und CNV: Short Read NGS
JUP 601214 AR Naxos-Syndrom (NXD) SNV und CNV: Short Read NGS
KDSR 617526 AR Erythrokeratodermia variabilis et progressive (EKVP4) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT1 144200 AD Epidermolytische Palmoplantarkeratose (EPPK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT1 600962 AD Nichtepidermolytische Palmoplantarkeratose (NEPPK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT1 607654 AD Keratosis palmoplantaris striata (PPKS3) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT1 113800 AD, AR Epidermolytische Hyperkeratose (EHK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT6A 615726 AD Pachyonychia congenita (PC3) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT6B 615728 AD Pachyonychia congenita (PC4) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT6C 615735 AD Fokale oder diffuse Palmoplantarkeratose (PPKNEFD) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT9 697606 AD Epidermolytische Palmoplantarkeratose (EPPK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT10 113800 AD, AR Epidermolytische Hyperkeratose (EHK) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT14 161000 AD Naegeli-Syndrom (NFJS) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT16 613000 AD Fokale Palmoplantarkeratose (FNEPPK1) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT16 167210 AD Pachyonychia congenita (PC1) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT17 167200 AD Pachyonychia congenita (PC2) SNV und CNV: Short Read NGS
KRT83 617756 AR Erythrokeratodermia variabilis et progressive (EKVP5) SNV und CNV: Short Read NGS
LORICRIN 604117 AD Vohwinkel-Syndrom, Variante SNV und CNV: Short Read NGS
MBTPS2 300918 XLR Olmsted-Syndrom (OLMSX, PPKMX) SNV und CNV: Short Read NGS
PERP 619209 AR Erythrokeratodermia variabilis et progressive (EKVP7) SNV und CNV: Short Read NGS
PERP 618208 AD Olmsted-Syndrom (OLMS2, PPKM2) SNV und CNV: Short Read NGS
RHBDF2 148500 AD Palmoplantarkeratose und Speiseröhrenkrebs (TOC) SNV und CNV: Short Read NGS
SERPINB7 615598 AR Palmoplantarkeratose, Nagashima-Typ (PPKN) SNV und CNV: Short Read NGS
SLURP1 248300 AR Keratosis palmoplantaris transgrediens (MDM) SNV und CNV: Short Read NGS
SMARCAD1 181600 AD Huriez-Syndrom (HRZ) SNV und CNV: Short Read NGS
TAT 276600 AR Palmoplantarkeratose mit Hornhautdystrophie (TYRSN2) SNV und CNV: Short Read NGS
TRPM4 618531 AD Erythrokeratodermia variabilis et progressive (EKVP6) SNV und CNV: Short Read NGS
TRPV3 616400 AD Fokale Palmoplantarkeratose (FNEPPK2) SNV und CNV: Short Read NGS
TRPV3 614594 AD Olmsted-Syndrom (OLMS1, PPKM1) SNV und CNV: Short Read NGS
WNT10A 224750 AR Schopf-Schulz-Passarge-Syndrom (SSPS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Palmoplantarkeratose (PPK), nicht-syndromal
AAGAB, AQP5, DSG1, DSP, KRT1, KRT10, KRT16, KRT6C, KRT9, SERPINB7, TRPV3
Palmoplantarkeratose (PPK), syndromal
CTSC, ENPP1, GJA1, GJB2, JUP, KRT14, LORICRIN, MBTPS2, PERP, RHBDF2, SLURP1, SMARCAD1, TAT, TRPV3, WNT10A
Erythrokeratodermia variabilis progressiva (EKVP)
GJA1, GJB3, GJB4, KDSR, KRT83, PERP, TRPM4
Pachyonychia congenita (PC)
KRT16, KRT17, KRT6A, KRT6B
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AAGAB, AQP5, CTSC, DSG1, DSP, ENPP1, GJA1, GJB2, GJB3, GJB4, JUP, KDSR, KRT1, KRT10, KRT14, KRT16, KRT17, KRT6A, KRT6B, KRT6C, KRT83, KRT9, LORICRIN, MBTPS2, PERP, RHBDF2, SERPINB7, SLURP1, SMARCAD1, TAT, TRPM4, TRPV3, WNT10A
HPO Terms
Hypergranulosis, Punctate palmoplantar hyperkeratosis, Palmoplantar hyperkeratosis, Palmoplantar keratoderma, Orthokeratosis, Hyperkeratosis, Nail dystrophy, Nail dysplasia, Hyperkeratotic papule, Knuckle pad, Palmoplantar scaling skin, Palmoplantar erythema, Palmoplantar blistering, Hyperhidrosis, Palmoplantar hyperhidrosis, Pruritus, Skin ulcer, Abnormal nail morphology, Hypergranulosis, Hyperkeratosis
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