SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID309.00
Peeling-Skin-Syndrom (PSS) : 6 Gene (13,626 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
CDSN 270300 AR Peeling-Skin-Syndrom (PSS1) SNV und CNV: Short Read NGS
CHST8 616265 AR Peeling-Skin-Syndrom (PSS3) SNV und CNV: Short Read NGS
CSTA 607936 AR Peeling-Skin-Syndrom (PSS4) SNV und CNV: Short Read NGS
FLG2 618084 AR Peeling-Skin-Syndrom (PSS6) SNV und CNV: Short Read NGS
SERPINB8 617118 AR Peeling-Skin-Syndrom (PSS5) SNV und CNV: Short Read NGS
TGM5 609796 AR Peeling-Skin-Syndrom (PSS2) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Peeling-Skin-Syndrom (PSS)
CDSN, CHST8, CSTA, FLG2, SERPINB8, TGM5
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CDSN, CHST8, CSTA, FLG2, SERPINB8, TGM5
HPO Terms
Cleavage at junction of stratum corneum and stratum granulosum, Hyperkeratosis, Scaling skin, Pruritus, Nail dystrophy, Onycholysis, Abnormal nail morphology, Dry skin, Ichthyosis, Orthokeratosis, Palmoplantar keratoderma, Abnormal eyelash morphology, Abnormal eyebrow morphology, Generalized hypotrichosis, Congenital onset, Infantile onset, Abnormal blistering of the skin, Autosomal recessive inheritance, Autosomal dominant inheritance, Eczematoid dermatitis
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