SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID151.02
Selektive Zahn-Agenesie (STHAG) : 16 Gene (26,709 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
EDA 313500 XLD STHAGX1 SNV und CNV: Short Read NGS
EDA 305100 XLR Ektodermale Dysplasie, Zahn-Typ (ECTD1) SNV und CNV: Short Read NGS
EDAR 224900 AR Ektodermale Dysplasie, Zahn-Typ (ECTD10B) SNV und CNV: Short Read NGS
EDARADD 614941 AR Ektodermale Dysplasie, Zahn-Typ (ECTD11B) SNV und CNV: Short Read NGS
GREM2 617275 AD STHAG9 SNV und CNV: Short Read NGS
IRF6 119300 AD STHAG (VWS) SNV und CNV: Short Read NGS
KDF1 617337 AD Ektodermale Dysplasie, Zahn-Typ (ECTD12) SNV und CNV: Short Read NGS
KREMEN1 617392 AR Ektodermale Dysplasie, Zahn-Typ (ECTD13) SNV und CNV: Short Read NGS
LRP6 616724 AD STHAG7 SNV und CNV: Short Read NGS
LTBP3 601216 AR STHAG6 (DASS) SNV und CNV: Short Read NGS
MSX1 106600 AD STHAG1 SNV und CNV: Short Read NGS
MSX1 189500 AD Ektodermale Dysplasie, Zahn-Typ (ECTD3) SNV und CNV: Short Read NGS
PAX9 604625 AD STHAG3 SNV und CNV: Short Read NGS
PTH1R 125350 AD STHAG (PFE) SNV und CNV: Short Read NGS
TP63 106260 AD STHAG (AEC) SNV und CNV: Short Read NGS
TSPEAR 618180 AR Ektodermale Dysplasie, Zahn-Typ (ECTD14) SNV und CNV: Short Read NGS
WNT10A 150400 AD, AR STHAG4 SNV und CNV: Short Read NGS
WNT10B 617073 AD STHAG8 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Selektive Zahn-Agenesie (STHAG)
EDA, EDA, EDAR, EDARADD, GREM2, IRF6, KDF1, KREMEN1, LRP6, LTBP3, MSX1, MSX1, PAX9, PTH1R, TP63, TSPEAR, WNT10A, WNT10B
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
EDA, EDAR, EDARADD, GREM2, IRF6, KDF1, KREMEN1, LRP6, LTBP3, MSX1, PAX9, PTH1R, TP63, TSPEAR, WNT10A, WNT10B
HPO Terms
Tooth agenesis, Selective tooth agenesis, Hypodontia, Oligodontia, Enamel hypoplasia, Delayed eruption of permanent teeth, Delayed eruption of teeth, Anodontia, Malocclusion, Abnormal dental morphology, Short dental root, Peg-shaped maxillary lateral incisors, Absent lateral incisor, Conical tooth, Abnormal primary molar morphology, Agenesis of central incisor, Agenesis of maxillary lateral incisor, Microdontia, Tooth malposition, Premature loss of primary teeth
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