SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID014.02
Brugada-Syndrom (BRGDA) : 23 Gene (56,400 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ABCC9 614050 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
CACNA1C 611875 AD BRGDA3 SNV und CNV: Short Read NGS
CACNA2D1 114204 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
CACNB2 611876 AD BRGDA4 SNV und CNV: Short Read NGS
FGF12 601144 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
GPD1L 611777 AD BRGDA2 SNV und CNV: Short Read NGS
HCN4 613123 AD BRGDA8 SNV und CNV: Short Read NGS
KCND2 605410 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
KCND3 616399 AD BRGDA9 SNV und CNV: Short Read NGS
KCNE3 613119 AD BRGDA6 SNV und CNV: Short Read NGS
KCNE5 300328 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
KCNH2 613688 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
KCNJ8 601144 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
PKP2 609040 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
RANGRF 607954 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
SCN1B 612838 AD BRGDA5 SNV und CNV: Short Read NGS
SCN2B 601144 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
SCN3B 613120 AD BRGDA7 SNV und CNV: Short Read NGS
SCN5A 601144 AD BRGDA1 SNV und CNV: Short Read NGS
SCN10A 601144 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
SEMA3A 601144 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
SLMAP 602701 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
TRPM4 606936 AD BRGDA SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Brugada-Syndrom (BRGDA)
ABCC9, CACNA1C, CACNA2D1, CACNB2, FGF12, GPD1L, HCN4, KCND2, KCND3, KCNE3, KCNE5, KCNH2, KCNJ8, PKP2, RANGRF, SCN10A, SCN1B, SCN2B, SCN3B, SCN5A, SEMA3A, SLMAP, TRPM4
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCC9, CACNA1C, CACNA2D1, CACNB2, FGF12, GPD1L, HCN4, KCND2, KCND3, KCNE3, KCNE5, KCNH2, KCNJ8, PKP2, RANGRF, SCN10A, SCN1B, SCN2B, SCN3B, SCN5A, SEMA3A, SLMAP, TRPM4
HPO Terms
Syncope, Palpitations, Sudden cardiac death, Sudden death, Ventricular tachycardia, Ventricular fibrillation, Premature ventricular contraction, Right bundle branch block, First degree atrioventricular block, Atrioventricular block, Abnormal ECG, Abnormal heart rhythm, Prolonged PR interval, J wave, Abnormal QRS complex, Prolonged QT interval, Shortened QT interval, Abnormal T wave, T wave inversion, Premature atrial contraction
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