SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID149.03
Hämochromatose (HFE) : 6 Gene (7,257 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
APOA1 620657 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD3) SNV und CNV: Short Read NGS
B2M 620659 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD6) SNV und CNV: Short Read NGS
FGA 105200 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD2) SNV und CNV: Short Read NGS
FTH1 615517 AD Hämochromatose (HFE5) SNV und CNV: Short Read NGS
GAA 232300 AR Glykogenspeicherkrankheit (GSD2) SNV und CNV: Short Read NGS
GLA 301500 XL Fabry-Krankheit SNV und CNV: Short Read NGS
GSN 105120 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD4) SNV und CNV: Short Read NGS
HAMP 613313 AR Hämochromatose (HFE2B) SNV und CNV: Short Read NGS
HFE 235200 AR Hämochromatose (HFE1) SNV und CNV: Short Read NGS
HJV 602390 AR Hämochromatose (HFE2A) SNV und CNV: Short Read NGS
LAMP2 300257 XLD Danon-Krankheit SNV und CNV: Short Read NGS
LYZ 105120 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD5) SNV und CNV: Short Read NGS
PRKAG2 261740 AD Glykogenspeicherkrankheit (GSD) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC40A1 606069 AD Hämochromatose (HFE4) SNV und CNV: Short Read NGS
TFR2 604250 AR Hämochromatose (HFE3) SNV und CNV: Short Read NGS
TTR 105210 AD Hereditäre systemische Amyloidose (AMYLD1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kardiale Glykogenspeicherkrankheit (GSD)
GAA, LAMP2, PRKAG2
Hämochromatose (HFE)
FTH1, HAMP, HFE, HJV, SLC40A1, TFR2
Amyloidose (AMYLD)
APOA1, B2M, FGA, GSN, LYZ, TTR
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
FTH1, HAMP, HFE, HJV, SLC40A1, TFR2
HPO Terms
Angiokeratoma, Corneal verticillata, Left ventricular hypertrophy, Dilated cardiomyopathy, Hypertrophic cardiomyopathy, Proteinuria, Renal failure, Hypohidrosis, Acroparesthesia, X-linked recessive inheritance, Shortened PR interval, Bundle branch block, Arrhythmia, Heart failure, Cardiomegaly, Ventricular preexcitation, Infantile onset, Elevated creatine kinase, Respiratory insufficiency
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