SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID012.03
Katecholaminerge polymorphe ventrikuläre Tachykardie (CPVT) : 9 Gene (33,894 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ANK2 600919 AD CPVT SNV und CNV: Short Read NGS
CALM1 614916 AD CPVT4 SNV und CNV: Short Read NGS
CALM2 616249 AD CPVT SNV und CNV: Short Read NGS
CALM3 618782 AD CPVT6 SNV und CNV: Short Read NGS
CASQ2 611939 AR CPVT2 SNV und CNV: Short Read NGS
KCNJ2 170390 AD CPVT SNV und CNV: Short Read NGS
RYR2 604772 AD CPVT1 SNV und CNV: Short Read NGS
TECRL 614021 aR CPVT3 SNV und CNV: Short Read NGS
TRDN 615441 AR CPVT5 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Katecholaminerge polymorphe ventrikuläre Tachykardie (CPVT)
ANK2, CALM1, CALM2, CALM3, CASQ2, KCNJ2, RYR2, TECRL, TRDN
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ANK2, CALM1, CALM2, CALM3, CASQ2, KCNJ2, RYR2, TECRL, TRDN
HPO Terms
Syncope, Autosomal dominant inheritance, Abnormal cardiac exercise stress test, Ventricular arrhythmia, Effort-induced polymorphic ventricular tachycardia, Sudden cardiac death, Ventricular tachycardia, Palpitations, Juvenile onset, Infantile onset, Premature ventricular contraction, Polymorphic ventricular tachycardia, Bidirectional ventricular tachycardia, Ventricular bigeminy, Ventricular couplet, Torsade de pointes, Exercise intolerance, Ventricular fibrillation, Cardiac arrest, Abnormal autonomic nervous system physiology
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