SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID302.01
Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD) : 9 Gene (21,543 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
FLT4 618780 AD Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD7) SNV und CNV: Short Read NGS
GATA5 617912 AD Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD5) SNV und CNV: Short Read NGS
GDF1 613854 AD Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD6) SNV und CNV: Short Read NGS
NR2F2 615779 AD Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD4) SNV und CNV: Short Read NGS
PLD1 212093 AR Multipler kongenitaler Herzdefekt (CVDP1) SNV und CNV: Short Read NGS
PLXND1 620294 AR Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD9) SNV und CNV: Short Read NGS
SMAD2 619657 AD Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD8) SNV und CNV: Short Read NGS
TAB2 614980 AD Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD2) SNV und CNV: Short Read NGS
ZIC3 306955 XLR Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Multipler kongenitaler Herzdefekt (CHTD)
FLT4, GATA5, GDF1, NR2F2, PLD1, PLXND1, SMAD2, TAB2, ZIC3
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
FLT4, GATA5, GDF1, NR2F2, PLD1, PLXND1, SMAD2, TAB2, ZIC3
HPO Terms
Ventricular septal defect, Atrial septal defect, Patent foramen ovale, Tricuspid atresia, Mitral atresia, Pulmonary stenosis, Pulmonic stenosis, Tricuspid stenosis, Mitral stenosis, Mitral regurgitation, Tricuspid regurgitation, Aortic stenosis, Aortic regurgitation, Coarctation of aorta, Transposition of great arteries, Double outlet right ventricle, Double inlet left ventricle, Hypoplastic left heart, Tetralogy of Fallot, Right aortic arch
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