SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID388.00
Perrault-Syndrom (PRLTS) : 9 Gene (14,097 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
CLPP 614127 AR Perrault-Syndrom (PRLTS3) SNV und CNV: Short Read NGS
DAP3 621101 AR Perrault-Syndrom (PRLTS7) SNV und CNV: Short Read NGS
ERAL1 617565 AR Perrault-Syndrom (PRLTS6) SNV und CNV: Short Read NGS
HARS2 614926 AR Perrault-Syndrom (PRLTS2) SNV und CNV: Short Read NGS
HSD17B4 233400 AR Perrault-Syndrom (PRLTS1) SNV und CNV: Short Read NGS
LARS2 615300 AR Perrault-Syndrom (PRLTS4) SNV und CNV: Short Read NGS
MRPL49 606866 AR Perrault-Syndrom (PRLTS) SNV und CNV: Short Read NGS
PRORP 619737 AR Perrault-Syndrom (PRLTS) SNV und CNV: Short Read NGS
TWNK 616138 AR Perrault-Syndrom (PRLTS5) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Perrault-Syndrom (PRLTS)
CLPP, DAP3, ERAL1, HARS2, HSD17B4, LARS2, MRPL49, PRORP, TWNK
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CLPP, DAP3, ERAL1, HARS2, HSD17B4, LARS2, MRPL49, PRORP, TWNK
HPO Terms
Sensorineural hearing impairment, Progressive sensorineural hearing impairment, Premature ovarian insufficiency, Primary amenorrhea, Hypergonadotropic hypogonadism, Seizure, Generalized seizure, Bilateral tonic-clonic seizure, Ataxia, Intention tremor, Global developmental delay, Motor delay, Motor regression, Intellectual disability, Dysarthria, Hypotonia, Peripheral neuropathy, Cerebellar atrophy, Streak ovary
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