SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID088.04
Periodische Fiebersyndrome : 12 Gene (26,328 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ELANE 162800 AD Zyklische Neutropenie SNV und CNV: Short Read NGS
MEFV 249100 AR Familiäres Mittelmeerfieber (FMF, autosomal-rezessiv) SNV und CNV: Short Read NGS
MEFV 134610 AD Familiäres Mittelmeerfieber (FMF, autosomal-dominant) SNV und CNV: Short Read NGS
MVK 260920 AR Hyper-IgD-Syndrom (HIDS) SNV und CNV: Short Read NGS
MVK 610377 AR Mevalonazidurie (MEVA) SNV und CNV: Short Read NGS
NLRC4 616115 AD Kälteinduziertes autoinflammatorisches Syndrom (FCAS4) SNV und CNV: Short Read NGS
NLRP3 120100 AD Kälteinduziertes autoinflammatorisches Syndrom (FCAS1, CAPS1) SNV und CNV: Short Read NGS
NLRP3 191900 AD Muckle-Wells-Syndrom (MWS, CAPS2) SNV und CNV: Short Read NGS
NLRP3 607115 AD CINCA-Syndrom (NOMID, CAPS3) SNV und CNV: Short Read NGS
NLRP12 611762 AD Kälteinduziertes autoinflammatorisches Syndrom (FCAS2) SNV und CNV: Short Read NGS
NOD2 186580 AD Blau-Syndrom (BLAUS) SNV und CNV: Short Read NGS
OTULIN 617099 AR Otulin-abhängiges autoinflammatorisches Syndrom (AIPDS) SNV und CNV: Short Read NGS
PLCG2 614468 AD Kälteinduziertes autoinflammatorisches Syndrom (FCAS3) SNV und CNV: Short Read NGS
PSTPIP1 601979 AD HZHC-Syndrom (AICZC) SNV und CNV: Short Read NGS
RIPK1 618852 AD CRIA-Syndrom (AIEFL) SNV und CNV: Short Read NGS
TNFRSF1A 142680 AD TNF-Rezeptor-assoziiertes periodisches Syndrom (FPF, TRAPS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Periodische Fiebersyndrome
ELANE, MEFV, MEFV, MVK, MVK, NLRC4, NLRP12, NLRP3, NLRP3, NLRP3, NOD2, OTULIN, PLCG2, PSTPIP1, RIPK1, TNFRSF1A
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ELANE, LPIN2, MEFV, MVK, NLRC4, NLRP12, NLRP3, NOD2, OTULIN, PLCG2, PSMB8, PSTPIP1, RIPK1, TNFRSF1A
HPO Terms
Periodic fever, Recurrent fever, Recurrent infections, Recurrent ear infections, Recurrent bacterial infections, Recurrent viral infections, Recurrent sinopulmonary infections, Pneumonia, Recurrent pharyngitis, Recurrent tonsillitis, Peritonitis, Abdominal pain, Recurrent infection of the gastrointestinal tract, Recurrent skin infections, Oral ulcer, Recurrent aphthous stomatitis, Elevated circulating C-reactive protein concentration, Elevated erythrocyte sedimentation rate, Elevated circulating interleukin 6 concentration, Neutropenia
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