SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID324.01
Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom (MTDPS) : 21 Gene (29,313 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AGK 212350 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, kardiomyopathischer Typ (MTDPS10) SNV und CNV: Short Read NGS
DGUOK 251880 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, hepatozerebraler Typ (MTDPS3) SNV und CNV: Short Read NGS
FBXL4 615471 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, enzephalomyopathischer Typ (MTDPS13) SNV und CNV: Short Read NGS
GUK1 621071 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, myopathischer Typ (MTDPS21) SNV und CNV: Short Read NGS
LIG3 619780 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, MNGIE-Typ (MTDPS20) SNV und CNV: Short Read NGS
MGME1 615084 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, myoophthalmischer Typ (MTDPS11) SNV und CNV: Short Read NGS
MPV17 256810 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, hepatozerebraler Typ (MTDPS6) SNV und CNV: Short Read NGS
MRM2 618567 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, neuromyopathischer Typ (MTDPS17) SNV und CNV: Short Read NGS
OPA1 616896 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, enzephalomyopathischer Typ (MTDPS14) SNV und CNV: Short Read NGS
POLG 203700 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, Alpers-Typ (MTDPS4A) SNV und CNV: Short Read NGS
POLG 613662 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, MNGIE-Typ (MTDPS4B) SNV und CNV: Short Read NGS
POLG2 618528 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, hepatischer Typ (MTDPS16A) SNV und CNV: Short Read NGS
POLG2 619425 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, neuroophtalmischer Typ (MTDPS16B) SNV und CNV: Short Read NGS
RRM2B 612075 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, enzephalomyopathischer Typ (MTDPS8A) SNV und CNV: Short Read NGS
RRM2B 612075 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, MNGIE-Typ (MTDPS8B) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC25A4 617184 AD Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, kardiomyopathischer Typ (MTDPS12A) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC25A4 615418 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, kardiomyopathischer Typ (MTDPS12B) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC25A10 618972 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, neuromyopathischer Typ (MTDPS19) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC25A21 618811 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, neuromyopathischer Typ (MTDPS18) SNV und CNV: Short Read NGS
SUCLA2 612073 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, enzephalomyopathischer Typ (MTDPS5) SNV und CNV: Short Read NGS
SUCLG1 245400 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, enzephalomyopathischer Typ (MTDPS9) SNV und CNV: Short Read NGS
TFAM 617156 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, hepatozerebraler Typ (MTDPS15) SNV und CNV: Short Read NGS
TK2 609560 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, myopathischer Typ (MTDPS2) SNV und CNV: Short Read NGS
TWNK 271245 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, hepatozerebraler Typ (MTDPS7) SNV und CNV: Short Read NGS
TYMP 603041 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom, MNGIE-Typ (MTDPS1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom (MTDPS)
AGK, DGUOK, FBXL4, GUK1, LIG3, MGME1, MPV17, MRM2, OPA1, POLG, POLG, POLG2, POLG2, RRM2B, RRM2B, SLC25A10, SLC25A21, SLC25A4, SLC25A4, SUCLA2, SUCLG1, TFAM, TK2, TWNK, TYMP
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AGK, DGUOK, FBXL4, GUK1, LIG3, MGME1, MPV17, MRM2, OPA1, POLG, POLG2, RRM2B, SLC25A10, SLC25A21, SLC25A4, SUCLA2, SUCLG1, TFAM, TK2, TWNK, TYMP
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