SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID093.02
Bardet-Biedl-Syndrom (BBS) : 21 Gene (39,072 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ARL6 600151 AR BBS3 SNV und CNV: Short Read NGS
BBIP1 615995 AR BBS18 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS1 209900 AR BBS1 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS2 615981 AR BBS2 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS4 615982 AR BBS4 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS5 615983 AR BBS5 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS7 615984 AR BBS7 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS9 615986 AR BBS9 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS10 615987 AR BBS10 SNV und CNV: Short Read NGS
BBS12 615989 AR BBS12 SNV und CNV: Short Read NGS
CEP290 615991 AR BBS14 SNV und CNV: Short Read NGS
CFAP418 617406 AR BBS21 SNV und CNV: Short Read NGS
IFT27 615996 AR BBS19 SNV und CNV: Short Read NGS
IFT74 617119 AR BBS20 SNV und CNV: Short Read NGS
LZTFL1 615994 AR BBS17 SNV und CNV: Short Read NGS
MKKS 605231 AR BBS6 SNV und CNV: Short Read NGS
MKS1 615990 AR BBS13 SNV und CNV: Short Read NGS
SDCCAG8 615993 AR BBS16 SNV und CNV: Short Read NGS
TRIM32 615988 AR BBS11 SNV und CNV: Short Read NGS
TTC8 615985 AR BBS8 SNV und CNV: Short Read NGS
WDPCP 615992 AR BBS15 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Bardet-Biedl-Syndrom (BBS)
ARL6, BBIP1, BBS1, BBS10, BBS12, BBS2, BBS4, BBS5, BBS7, BBS9, CEP290, CFAP418, IFT27, IFT74, LZTFL1, MKKS, MKS1, SDCCAG8, TRIM32, TTC8, WDPCP
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ARL6, BBIP1, BBS1, BBS10, BBS12, BBS2, BBS4, BBS5, BBS7, BBS9, CEP290, CFAP418, IFT172, IFT27, IFT74, LZTFL1, MKKS, MKS1, SDCCAG8, TRIM32, TTC8, WDPCP
HPO Terms
Retinitis pigmentosa, Rod-cone dystrophy, Cone-rod dystrophy, Night blindness, Polydactyly, Truncal obesity, Renal cysts, Nephronophthisis, Intellectual disability, Global developmental delay, Speech delay, Hypotonia, Hypogonadism, Dental crowding, Short stature, Hearing impairment, Chronic kidney disease, Visual impairment, Neurogenic bladder
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