SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID035.03
Kongenitale Glykosylierungsstörung (CDG) : 58 Gene (86,229 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
SNV und CNV: Short Read NGS
ALG1 608540 AR CDG-Syndrom (CDG1K) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG2 607906 AR CDG-Syndrom (CDG1I) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG3 601110 AR CDG-Syndrom (CDG1D) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG6 603147 AR CDG-Syndrom (CDG1C) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG8 608104 AR CDG-Syndrom (CDG1H) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG9 608776 AR CDG-Syndrom (CDG1L) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG11 613661 AR CDG-Syndrom (CDG1P) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG12 607143 AR CDG-Syndrom (CDG1G) SNV und CNV: Short Read NGS
ALG13 300884 XLD CDG-Syndrom (CDG1S) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP6AP1 300972 XLR CDG-Syndrom (CDG2S) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP6AP2 301045 XLR CDG-Syndrom (CDG2R) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP6V0A2 219200 AR CDG-Syndrom (CDG1) SNV und CNV: Short Read NGS
B4GALT1 607091 AR CDG-Syndrom (CDG2D) SNV und CNV: Short Read NGS
CAMLG 620201 AR CDG-Syndrom (CDG2Z) SNV und CNV: Short Read NGS
COG1 611209 AR CDG-Syndrom (CDG2G) SNV und CNV: Short Read NGS
COG2 617395 AR CDG-Syndrom (CDG2Q) SNV und CNV: Short Read NGS
COG3 620546 AR CDG-Syndrom (CDG2BB) SNV und CNV: Short Read NGS
COG4 613489 AR CDG-Syndrom (CDG2J) SNV und CNV: Short Read NGS
COG5 613612 AR CDG-Syndrom (CDG2I) SNV und CNV: Short Read NGS
COG6 614576 AR CDG-Syndrom (CDG2L) SNV und CNV: Short Read NGS
COG7 608779 AR CDG-Syndrom (CDG2E) SNV und CNV: Short Read NGS
COG8 611182 AR CDG-Syndrom (CDG2H) SNV und CNV: Short Read NGS
DDOST 614507 AR CDG-Syndrom (CDG1R) SNV und CNV: Short Read NGS
DHDDS 613861 AR CDG-Syndrom (CDG1BB) SNV und CNV: Short Read NGS
DHRSX 301133 PR CDG-Syndrom (CDG1DD) SNV und CNV: Short Read NGS
DOLK 610768 AR CDG-Syndrom (CDG1M) SNV und CNV: Short Read NGS
DPAGT1 608093 AR CDG-Syndrom (CDG1J) SNV und CNV: Short Read NGS
DPM1 608799 AR CDG-Syndrom (CDG1E) SNV und CNV: Short Read NGS
DPM2 603564 AR CDG-Syndrom (CDG1U) SNV und CNV: Short Read NGS
DPM3 612937 AR CDG-Syndrom (CDG1O) SNV und CNV: Short Read NGS
EDEM2 619493 AR CDG-Syndrom (CDG2V) SNV und CNV: Short Read NGS
GALNT2 618885 AR CDG-Syndrom (CDG2T) SNV und CNV: Short Read NGS
GET4 620200 AR CDG-Syndrom (CDG2Y) SNV und CNV: Short Read NGS
MAGT1 301031 XLR CDG-Syndrom (CDG1CC) SNV und CNV: Short Read NGS
MAN1B1 614202 AR CDG-Syndrom (CDG2U) SNV und CNV: Short Read NGS
MAN2B2 621140 AR CDG-Syndrom (CDG1EE) SNV und CNV: Short Read NGS
MGAT2 212066 AR CDG-Syndrom (CDG2A) SNV und CNV: Short Read NGS
MOGS 606056 AR CDG-Syndrom (CDG2B) SNV und CNV: Short Read NGS
MPDU1 609180 AR CDG-Syndrom (CDG1F) SNV und CNV: Short Read NGS
MPI 602579 AR CDG-Syndrom (CDG1B) SNV und CNV: Short Read NGS
NUS1 617082 AR CDG-Syndrom (CDG1AA) SNV und CNV: Short Read NGS
PGM1 614921 AR CDG-Syndrom (CDG1T) SNV und CNV: Short Read NGS
PMM2 212065 AR CDG-Syndrom (CDG1A) SNV und CNV: Short Read NGS
RFT1 612015 AR CDG-Syndrom (CDG1N) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC35A1 603585 AR CDG-Syndrom (CDG2F) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC35A2 300896 XLD CDG-Syndrom (CDG2M) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC35C1 266265 AR CDG-Syndrom (CDG2C) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC37A4 619525 AD CDG-Syndrom (CDG2W) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC39A8 616721 AR CDG-Syndrom (CDG2N) SNV und CNV: Short Read NGS
SRD5A3 612379 AR CDG-Syndrom (CDG1Q) SNV und CNV: Short Read NGS
SSR4 300934 XLR CDG-Syndrom (CDG1Y) SNV und CNV: Short Read NGS
STT3A 615596 AR CDG-Syndrom (CDG1W) SNV und CNV: Short Read NGS
STT3B 615597 AR CDG-Syndrom (CDG1X) SNV und CNV: Short Read NGS
STX5 620454 AR CDG-Syndrom (CDG2AA) SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM165 614727 AR CDG-Syndrom (CDG2K) SNV und CNV: Short Read NGS
TUSC3 301031 AR CDG-Syndrom (CDG1) SNV und CNV: Short Read NGS
VMA12 616829 AR CDG-Syndrom (CDG2P) SNV und CNV: Short Read NGS
VMA22 616828 AR CDG-Syndrom (CDG2O) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kongenitale Glykosylierungsstörung, Typ I (CDG1)
ALG1, ALG11, ALG12, ALG13, ALG2, ALG3, ALG6, ALG8, ALG9, ATP6V0A2, DDOST, DHDDS, DHRSX, DOLK, DPAGT1, DPM1, DPM2, DPM3, MAGT1, MAN2B2, MPDU1, MPI, NUS1, PGM1, PMM2, RFT1, SRD5A3, SSR4, STT3A, STT3B, TUSC3
Kongenitale Glykosylierungstörung, Typ II (CDG2)
ATP6AP1, ATP6AP2, B4GALT1, CAMLG, COG1, COG2, COG3, COG4, COG5, COG6, COG7, COG8, EDEM2, GALNT2, GET4, MAN1B1, MGAT2, MOGS, SLC35A1, SLC35A2, SLC35C1, SLC37A4, SLC39A8, STX5, TMEM165, VMA12, VMA22
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ALG1, ALG11, ALG12, ALG13, ALG2, ALG3, ALG6, ALG8, ALG9, ATP6AP1, ATP6AP2, ATP6V0A2, B4GALT1, CAMLG, COG1, COG2, COG3, COG4, COG5, COG6, COG7, COG8, DDOST, DHDDS, DHRSX, DOLK, DPAGT1, DPM1, DPM2, DPM3, EDEM2, GALNT2, GET4, MAGT1, MAN1B1, MAN2B2, MGAT2, MOGS, MPDU1, MPI, NUS1, PGM1, PMM2, RFT1, SLC35A1, SLC35A2, SLC35C1, SLC37A4, SLC39A8, SRD5A3, SSR4, STT3A, STT3B, STX5, TMEM165, TUSC3, VMA12, VMA22
HPO Terms
Generalized hypotonia, Developmental delay, Intellectual disability, Seizure, Microcephaly, Short stature, Hepatomegaly, Elevated circulating hepatic transaminase concentration, Cerebellar atrophy, Ataxia, Sensorineural hearing impairment, Cataract, Retinal dystrophy, Peripheral neuropathy, Feeding difficulties, Failure to thrive, Hypoglycemia, Growth retardation, Abnormal facial shape, Dysphagia
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