SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID084.00
Zellweger-Syndrom (ZWS) : 14 Gene (22,245 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ACOX1 264470 AR Peroxisomaler Acyl-CoA-Oxidase-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
HSD17B4 261515 AR Peroxisomaler D-bifunktionales Enzym-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
PEX1 214100 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 1A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX2 614866 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 5A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX3 614882 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 10A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX5 214110 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 2A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX6 614862 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 4A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX10 614870 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 6A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX12 614859 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 3A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX13 614883 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 11A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX14 614887 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 13A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX16 614876 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 8A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX19 614886 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 12A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
PEX26 614872 AR Störung der peroxisomalen Biogenese 7A (Zellweger) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Zellweger-Syndrom (ZWS)
ACOX1, HSD17B4, PEX1, PEX10, PEX12, PEX13, PEX14, PEX16, PEX19, PEX2, PEX26, PEX3, PEX5, PEX6
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACOX1, HSD17B4, PEX1, PEX10, PEX12, PEX13, PEX14, PEX16, PEX19, PEX2, PEX26, PEX3, PEX5, PEX6
HPO Terms
Generalized hypotonia, Seizure, Developmental delay, Hepatomegaly, Renal cyst, Cataract, Hearing impairment, Retinal dystrophy, Very long chain fatty acid accumulation, Elevated circulating phytanic acid concentration, Cerebellar hypoplasia, Large fontanelle, Epicanthal folds, Depressed nasal bridge, Short stature, Growth retardation, Cerebral dysmyelination, Brain atrophy, High forehead, Broad nasal root
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