SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID128.04
Dystonie (DYT) : 41 Gene (84,281 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ACTB 607371 AD Dystonie-Taubheit-Syndrom (DDS1) SNV und CNV: Short Read NGS
ADCY5 606703 AD Dystonie (DYT) SNV und CNV: Short Read NGS
ANO3 615034 AD Dystonie (DYT24) SNV und CNV: Short Read NGS
AOPEP 619565 AR Dystonie (DYT31) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP1A3 128235 AD Dystonie (DYT12) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP5MC3 619681 AD Dystonie und spastische Paraplegie (DYTSPG) SNV und CNV: Short Read NGS
BCAP31 300475 XLR Dystonie-Taubheit-Syndrom (DDCH) SNV und CNV: Short Read NGS
COL6A3 616411 AR Dystonie (DYT27) SNV und CNV: Short Read NGS
ECHS1 616277 AR Dystonie (DYT) SNV und CNV: Short Read NGS
EIF2AK2 619687 AD, AR Dystonie (DYT33) SNV und CNV: Short Read NGS
GCH1 128230 AD Dystonie (DYT5, DRD) SNV und CNV: Short Read NGS
GNAL 615073 AD Dystonie (DYT25) SNV und CNV: Short Read NGS
HPCA 224500 AR Dystonie (DYT2) SNV und CNV: Short Read NGS
KCNN2 619724 AD Dystonie (DYT34) SNV und CNV: Short Read NGS
KCTD17 616398 AD Dystonie (DYT26) SNV und CNV: Short Read NGS
KMT2B 617284 AD Dystonie (DYT28) SNV und CNV: Short Read NGS
MECR 617282 AR Dystonie (DYT29, DYTOABG) SNV und CNV: Short Read NGS
NUP54 620427 AR Dystonie (DYT37) SNV und CNV: Short Read NGS
PLA2G6 612953 AR Parkinsonismus-Dystonie-Syndrom (PARK14) SNV und CNV: Short Read NGS
PNKD 118800 AD Dystonie (DYT8, PNKD1) SNV und CNV: Short Read NGS
PRKRA 612067 AR Dystonie (DYT16) SNV und CNV: Short Read NGS
PRRT2 128200 AD Dystonie (DYT10, EKD1) SNV und CNV: Short Read NGS
SGCE 159900 AD Dystonie (DYT11) SNV und CNV: Short Read NGS
SHQ1 619921 AR Dystonie (DYT35) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC2A1 601042 AD Dystonie (DYT9) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC2A1 612126 AD Dystonie (DYT18, GLUT1DS2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC6A3 613135 AR Parkinsonismus-Dystonie-Syndrom (PKDYS1) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC18A2 618049 AR Parkinsonismus-Dystonie-Syndrom (PKDYS2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC30A10 613280 AR Hypermanganämie mit Dystonie (HMNDYT1) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC39A14 617013 AR Hypermanganämie mit Dystonie (HMNDYT2) SNV und CNV: Short Read NGS
SPR 612716 AR Dystonie (DRD) SNV und CNV: Short Read NGS
TAF1 314250 XLR Dystonie (DYT3) SNV und CNV: Short Read NGS
TH 605407 AR Dystonie (DRD) SNV und CNV: Short Read NGS
THAP1 602629 AD Dystonie (DYT6) SNV und CNV: Short Read NGS
TIMM8A 304700 XLR Dystonie-Taubheit-Syndrom (DDSX) SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM151A 620245 AD Dystonie (DYT36, EKD3) SNV und CNV: Short Read NGS
TOR1A 128100 AD Dystonie (DYT1) SNV und CNV: Short Read NGS
TSPOAP1 620452 AR Dystonie 22 (DYT22JO) SNV und CNV: Short Read NGS
TSPOAP1 620456 AR Dystonie 22 (DYT22AO) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB4A 128101 AD Dystonie (DYT4) SNV und CNV: Short Read NGS
VPS11 619637 AR Dystonie (DYT32) SNV und CNV: Short Read NGS
VPS16 619291 AD Dystonie (DYT30) SNV und CNV: Short Read NGS
WARS2 619738 AR Parkinsonismus-Dystonie-Syndrom (PKDYS3) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Dystonie (DYT), isolierte Form
ADCY5, ANO3, COL6A3, ECHS1, GNAL, HPCA, KCNN2, KCTD17, KMT2B, SHQ1, SLC2A1, THAP1, TOR1A, TUBB4A, VPS11
Dystonie (DYT), kombinierte Form
ACTB, ADCY5, AOPEP, ATP1A3, ATP5MC3, BCAP31, ECHS1, EIF2AK2, GCH1, MECR, NUP54, PLA2G6, PNKD, PRKRA, PRRT2, SGCE, SHQ1, SLC18A2, SLC2A1, SLC30A10, SLC39A14, SLC6A3, SPR, TAF1, TH, TIMM8A, TMEM151A, VPS16, WARS2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACTB, ADCY5, ANO3, AOPEP, ATP1A3, ATP5MC3, BCAP31, COL6A3, ECHS1, EIF2AK2, GCH1, GNAL, HPCA, KCNN2, KCTD17, KMT2B, MECR, NUP54, PLA2G6, PNKD, PRKRA, PRRT2, SGCE, SHQ1, SLC18A2, SLC2A1, SLC30A10, SLC39A14, SLC6A3, SPR, TAF1, TH, THAP1, TIMM8A, TMEM151A, TOR1A, TSPOAP1, TUBB4A, VPS11, VPS16, WARS2
HPO Terms
Generalized dystonia, Focal dystonia, Limb dystonia, Oromandibular dystonia, Torticollis, Dysarthria, Gait disturbance, Dysphagia, Abnormal posturing, Tremor, Muscle stiffness, Abnormal movement, Hypertonia, Hyperreflexia, Facial dystonia, Cervical dystonia, Dyskinesia, Abnormal gait, Hand dystonia, Neck muscle weakness
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