SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID216.00
Hyperekplexie (HKPX) : 9 Gene (16,014 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ACTL6B 618468 AR HKPX und Epilepsie (EIEE76) SNV und CNV: Short Read NGS
ARHGEF9 300607 XLR HKPX und Epilepsie (EIEE8) SNV und CNV: Short Read NGS
ASNS 615574 AR HKPX und Mikrozephalie (ASNSD) SNV und CNV: Short Read NGS
ATAD1 618011 AR HKPX4 SNV und CNV: Short Read NGS
GLRA1 149400 AD, AR HKPX1 SNV und CNV: Short Read NGS
GLRB 614619 AR HKPX2 SNV und CNV: Short Read NGS
GPHN 149400 AR HKPX SNV und CNV: Short Read NGS
SLC6A5 614618 AD, AR HKPX3 SNV und CNV: Short Read NGS
TRAK1 618201 AR HKPX und Epilepsie (EIEE68) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hyperekplexie (HKPX)
ACTL6B, ARHGEF9, ASNS, ATAD1, GLRA1, GLRB, GPHN, SLC6A5, TRAK1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACTL6B, ARHGEF9, ASNS, ATAD1, GLRA1, GLRB, GPHN, SLC6A5, TRAK1
HPO Terms
Exaggerated startle response, Apnea, Neonatal onset, Infantile onset, Feeding difficulties in infancy, Global developmental delay, Seizure, Generalized tonic seizure, Generalized myoclonic seizure, Hypertonia, Spasticity, Respiratory distress, Respiratory arrest, Respiratory insufficiency, Sleep apnea, Abnormality of movement, Involuntary movements, Irritability, Motor delay, Aspiration
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