SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID277.00
Hypomyelinisierende Leukodystrophie (HLD) : 22 Gene (34,949 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AIMP1 260600 AR HLD3 SNV und CNV: Short Read NGS
AIMP2 618006 AR HLD17 SNV und CNV: Short Read NGS
CLDN11 619328 AD HLD22 SNV und CNV: Short Read NGS
CNP 613071 AR HLD20 SNV und CNV: Short Read NGS
DEGS1 618404 AR HLD18 SNV und CNV: Short Read NGS
EPRS1 617951 AR HLD15 SNV und CNV: Short Read NGS
GJC2 608804 AR HLD2 SNV und CNV: Short Read NGS
HIKESHI 616881 AR HLD13 SNV und CNV: Short Read NGS
HSPD1 612233 AR HLD4 SNV und CNV: Short Read NGS
HYCC1 610532 AR HLD5 SNV und CNV: Short Read NGS
PLP1 312080 XLR Pelizaeus-Merzbacher-Krankheit (HLD1) SNV und CNV: Short Read NGS
POLR1C 616494 AR HLD11 SNV und CNV: Short Read NGS
POLR3A 607694 AR HLD7 SNV und CNV: Short Read NGS
POLR3B 614381 AR HLD8 SNV und CNV: Short Read NGS
POLR3K 619310 AR HLD21 SNV und CNV: Short Read NGS
PYCR2 616420 AR HLD10 SNV und CNV: Short Read NGS
RARS1 107820 AR HLD9 SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM63A 618688 AD HLD19 SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM106B 617964 AD HLD16 SNV und CNV: Short Read NGS
TUBB4A 602662 AR HLD6 SNV und CNV: Short Read NGS
UFM1 610553 AR HLD14 SNV und CNV: Short Read NGS
VPS11 616683 AR HLD12 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hypomyelinisierende Leukodystrophie (HLD)
AIMP1, AIMP2, CLDN11, CNP, DEGS1, EPRS1, GJC2, HIKESHI, HSPD1, HYCC1, PLP1, POLR1C, POLR3A, POLR3B, POLR3K, PYCR2, RARS1, TMEM106B, TMEM63A, TUBB4A, UFM1, VPS11
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AIMP1, AIMP2, CLDN11, CNP, DEGS1, EPRS1, GJC2, HIKESHI, HSPD1, HYCC1, PLP1, POLR1C, POLR3A, POLR3B, POLR3K, PYCR2, RARS1, TMEM106B, TMEM63A, TUBB4A, UFM1, VPS11
HPO Terms
Leukodystrophy, CNS hypomyelination, Delayed CNS myelination, Global developmental delay, Seizure, Spasticity, Hyperreflexia, Cerebral atrophy, Microcephaly, Visual impairment, Hearing impairment, Dysarthria, Feeding difficulties, Ataxia, Peripheral neuropathy, Abnormal periventricular white matter morphology, Abnormal cerebral white matter morphology, Dysphagia, Hypotonia
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