Leistungsverzeichnis - Neuronale Ceroid-Lipofuszinose (CLN) : 15 Gene (20,223 kb)

Material	Dauer	Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut	3 - 5 Wochen	ja

Untersuchte Bereiche / Gene

Genotyp	OMIM-P	Erbgang	Phänotyp	Methodik
ASAH1	228000	AR	CLN (FRBRL)	SNV und CNV: Short Read NGS
ATP13A2	606693	AR	CLN12	SNV und CNV: Short Read NGS
CLN3	204200	AR	CLN3	SNV und CNV: Short Read NGS
CLN5	256731	AR	CLN5	SNV und CNV: Short Read NGS
CLN6	204300	AR	CLN4A	SNV und CNV: Short Read NGS
CLN6	601780	AR	CLN6	SNV und CNV: Short Read NGS
CLN8	600143	AR	CLN8	SNV und CNV: Short Read NGS
CTSD	610127	AR	CLN10	SNV und CNV: Short Read NGS
CTSF	615362	AR	CLN13	SNV und CNV: Short Read NGS
DNAJC5	162350	AD	CLN4B	SNV und CNV: Short Read NGS
GRN	614706	AR	CLN11	SNV und CNV: Short Read NGS
KCTD7	611726	AR	CLN14	SNV und CNV: Short Read NGS
MFSD8	610951	AR	CLN7	SNV und CNV: Short Read NGS
NHLRC1	254780	AR	CLN (LBD)	SNV und CNV: Short Read NGS
PPT1	256730	AR	CLN1	SNV und CNV: Short Read NGS
TPP1	204500	AR	CLN2	SNV und CNV: Short Read NGS

Methodik

ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.

Neuronale Ceroid-Lipofuszinose (CLN)

ASAH1, ATP13A2, CLN3, CLN5, CLN6, CLN6, CLN8, CTSD, CTSF, DNAJC5, GRN, KCTD7, MFSD8, NHLRC1, PPT1, TPP1

Kosten

Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.

Gesamte Genliste

ASAH1, ATP13A2, CLN3, CLN5, CLN6, CLN8, CTSD, CTSF, DNAJC5, GRN, KCTD7, MFSD8, NHLRC1, PPT1, TPP1

HPO Terms

Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset, Generalized myoclonic seizure, Seizure, Developmental delay, Developmental regression, Intellectual disability, Cognitive impairment, Motor regression, Spasticity, Ataxia, Gait ataxia, Vision loss, Visual impairment, Reduced visual acuity, Retinal dystrophy, Retinal degeneration, Macular degeneration, Cherry red spot of the macula, Optic disc pallor, Loss of ambulation