SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID086.02
Hereditäre sensorische und autonome Neuropathie (HSAN, HSN) : 16 Gene (57,483 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ATL1 613768 AD Sensorische Neuropathie (HSN1D) SNV und CNV: Short Read NGS
ATL3 615632 AD Sensorische Neuropathie (HSN1F) SNV und CNV: Short Read NGS
DNMT1 614116 AD Sensorische Neuropathie (HSN1E) SNV und CNV: Short Read NGS
DST 614653 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN6) SNV und CNV: Short Read NGS
ELP1 223900 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN3) SNV und CNV: Short Read NGS
KIF1A 614213 AR Sensorische Neuropathie (HSN2C) SNV und CNV: Short Read NGS
NGF 608654 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN5) SNV und CNV: Short Read NGS
NTRK1 256800 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN4) SNV und CNV: Short Read NGS
PRDM12 616488 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN8) SNV und CNV: Short Read NGS
RETREG1 613115 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN2B) SNV und CNV: Short Read NGS
SCN9A 243000 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN2D) SNV und CNV: Short Read NGS
SCN11A 615548 AD Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN7) SNV und CNV: Short Read NGS
SPTLC1 162400 AD Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN1A) SNV und CNV: Short Read NGS
SPTLC2 613640 AD Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN1C) SNV und CNV: Short Read NGS
TECPR2 615031 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN9) SNV und CNV: Short Read NGS
WNK1 201300 AR Sensorische und autonome Neuropathie (HSAN2A) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hereditäre sensorische und autonome Neuropathie (HSAN, HSN)
ATL1, ATL3, DNMT1, DST, ELP1, KIF1A, NGF, NTRK1, PRDM12, RETREG1, SCN11A, SCN9A, SPTLC1, SPTLC2, TECPR2, WNK1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ATL1, ATL3, DNMT1, DST, ELP1, KIF1A, NGF, NTRK1, PRDM12, RETREG1, SCN11A, SCN9A, SPTLC1, SPTLC2, TECPR2, WNK1
HPO Terms
Impaired vibratory sensation, Distal muscle weakness, Gait disturbance, Urinary incontinence, Hyperhidrosis, Autoamputation of digits, Muscle weakness, Urinary urgency, Nail dystrophy, Pain insensitivity, Peripheral axonal neuropathy, Paresthesia, Abnormality of autonomic nervous system, Insidious onset, Poor wound healing, Foot dorsiflexor weakness, Hyperkeratosis, Neuropathic arthropathy, Urinary bladder sphincter dysfunction, Foot ulcer
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