SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID199.00
Nemalin-Myopathie (NEM) : 11 Gene (40,578 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ACTA1 161800 AD, AR NEM3 SNV und CNV: Short Read NGS
CFL2 601443 AR NEM7 SNV und CNV: Short Read NGS
KBTBD13 609273 AD NEM6 SNV und CNV: Short Read NGS
KLHL40 615348 AR NEM9 SNV und CNV: Short Read NGS
KLHL41 615731 AR NEM8 SNV und CNV: Short Read NGS
LMOD3 616165 AR NEM10 SNV und CNV: Short Read NGS
MYPN 608517 AR NEM11 SNV und CNV: Short Read NGS
NEB 256030 AR NEM2 SNV und CNV: Short Read NGS
TNNT1 605355 AR NEM5 SNV und CNV: Short Read NGS
TPM2 609285 AD NEM4 SNV und CNV: Short Read NGS
TPM3 609284 AD, AR NEM1 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Nemalin-Myopathie (NEM)
ACTA1, CFL2, KBTBD13, KLHL40, KLHL41, LMOD3, MYPN, NEB, TNNT1, TPM2, TPM3
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACTA1, CFL2, KBTBD13, KLHL40, KLHL41, LMOD3, MYPN, NEB, TNNT1, TPM2, TPM3
HPO Terms
Neonatal hypotonia, Generalized hypotonia, Distal muscle weakness, Proximal muscle weakness, Axial muscle weakness, Delayed gross motor development, Feeding difficulties in infancy, Respiratory insufficiency due to muscle weakness, Respiratory failure requiring assisted ventilation, Reduced vital capacity, Scoliosis, Joint contracture, Bulbar signs, Dysphagia, Abnormal muscle fiber morphology, Generalized muscle weakness, Delayed ability to walk, Weakness of facial musculature, Respiratory distress, Myopathic facies
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