SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID251.01
Galloway-Mowat-Syndrom (GAMOS) : 10 Gene (12,498 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
GON7 619603 AR GAMOS9 SNV und CNV: Short Read NGS
LAGE3 301006 XLR GAMOS2 SNV und CNV: Short Read NGS
NUP107 618348 AR GAMOS7 SNV und CNV: Short Read NGS
NUP133 618349 AR GAMOS8 SNV und CNV: Short Read NGS
OSGEP 617729 AR GAMOS3 SNV und CNV: Short Read NGS
TP53RK 617730 AR GAMOS4 SNV und CNV: Short Read NGS
TPRKB 617731 AR GAMOS5 SNV und CNV: Short Read NGS
WDR4 618347 AR GAMOS6 SNV und CNV: Short Read NGS
WDR73 251300 AR GAMOS1 SNV und CNV: Short Read NGS
YRDC 619609 AR GAMOS10 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Galloway-Mowat-Syndrom (GAMOS)
GON7, LAGE3, NUP107, NUP133, OSGEP, TP53RK, TPRKB, WDR4, WDR73, YRDC
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
GON7, LAGE3, NUP107, NUP133, OSGEP, TP53RK, TPRKB, WDR4, WDR73, YRDC
HPO Terms
Nephrotic syndrome, Diffuse mesangial sclerosis, Focal segmental glomerulosclerosis, Proteinuria, Chronic kidney disease, Microcephaly, Seizure, Global developmental delay, Hypotonia, Spasticity, Ataxia, Cerebellar atrophy, Cerebral cortical atrophy, Cerebellar hypoplasia, Brain atrophy, Cognitive impairment, Intellectual disability, Failure to thrive, Abnormality of the nervous system, Hypertonia
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