SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID363.00
Hyperoxalurie : 6 Gene (8,550 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 2 - 4 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AGXT 259900 AR Primäre Hyperoxalurie, Typ I (PH1) SNV und CNV: Short Read NGS
GRHPR 260000 AR Primäre Hyperoxalurie, Typ II (PH2) SNV und CNV: Short Read NGS
HOGA1 613616 AR Primäre Hyperoxalurie, Typ III (PH3) SNV und CNV: Short Read NGS
OXGR1 620374 AD Kalziumoxalat-Nephrolithiasis (CAON2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC26A1 167030 AR Kalziumoxalat-Nephrolithiasis (CAON1) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC26A6 167030 AR Kalziumoxalat-Nephrolithiasis (CAON1) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Primäre Hyperoxalurie (PH)
AGXT, GRHPR, HOGA1
Kalziumoxalat-Nephrolithiasis (CAON)
OXGR1, SLC26A1, SLC26A6
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AGXT, GRHPR, HOGA1, OXGR1, SLC26A1, SLC26A6
HPO Terms
Hyperoxaluria, Calcium oxalate nephrolithiasis, Nephrolithiasis, Nephrocalcinosis, Renal insufficiency, Decreased glomerular filtration rate, Stage 5 chronic kidney disease, Acute kidney injury, Elevated urinary glyoxylic acid level, Elevated urinary glycolic acid level, Reduced hepatic alanine-glyoxylate aminotransferase activity, Reduced hepatic glyoxylate reductase activity, Optic neuropathy, Optic atrophy, Retinal crystals, Retinopathy, Abnormality of metabolism/homeostasis, Abnormality of urine calcium concentration, Abnormal circulating enzyme concentration, Abnormality of urine homeostasis
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