SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID030.02
Nephronophthise (NPHP) : 22 Gene (70,875 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ANKS6 615382 AR NPHP16 SNV und CNV: Short Read NGS
CEP83 615862 AR NPHP18 SNV und CNV: Short Read NGS
CEP164 614845 AR NPHP15 SNV und CNV: Short Read NGS
CEP290 610142 AR NPHP6 SNV und CNV: Short Read NGS
DCDC2 616217 AR NPHP19 SNV und CNV: Short Read NGS
GLIS2 611498 AR NPHP7 SNV und CNV: Short Read NGS
IFT172 615630 AR NPHP17 SNV und CNV: Short Read NGS
INVS 602088 AR NPHP2 SNV und CNV: Short Read NGS
IQCB1 609237 AR NPHP5 SNV und CNV: Short Read NGS
MAPKBP1 617271 AR NPHP20 SNV und CNV: Short Read NGS
NEK8 613824 AR NPHP9 SNV und CNV: Short Read NGS
NPHP1 256100 AR NPHP1 SNV und CNV: Short Read NGS
NPHP3 604387 AR NPHP3 SNV und CNV: Short Read NGS
NPHP4 606966 AR NPHP4 SNV und CNV: Short Read NGS
RPGRIP1L 611560 AR NPHP8 SNV und CNV: Short Read NGS
SDCCAG8 613615 AR NPHP10 SNV und CNV: Short Read NGS
SLC41A1 619468 AR NPHPL2 SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM67 613550 AR NPHP11 SNV und CNV: Short Read NGS
TTC21B 613820 AR NPHP12 SNV und CNV: Short Read NGS
WDR19 614377 AR NPHP13 SNV und CNV: Short Read NGS
XPNPEP3 613159 AR NPHPL1 SNV und CNV: Short Read NGS
ZNF423 614844 AR NPHP14 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Nephronophthise (NPHP)
ANKS6, CEP164, CEP290, CEP83, DCDC2, GLIS2, IFT172, INVS, IQCB1, MAPKBP1, NEK8, NPHP1, NPHP3, NPHP4, RPGRIP1L, SDCCAG8, SLC41A1, TMEM67, TTC21B, WDR19, XPNPEP3, ZNF423
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ANKS6, CEP164, CEP290, CEP83, DCDC2, GLIS2, IFT172, INVS, IQCB1, MAPKBP1, NEK8, NPHP1, NPHP3, NPHP4, RPGRIP1L, SDCCAG8, SLC41A1, TMEM67, TTC21B, WDR19, XPNPEP3, ZNF423
HPO Terms
Nephronophthisis, Renal insufficiency, Chronic kidney disease, Stage 5 chronic kidney disease, Renal cyst, Multiple renal cysts, Renal cortical cysts, Renal cortical microcysts, Renal tubular atrophy, Renal interstitial fibrosis, Proteinuria, Polyuria, Renal interstitial inflammation, Retinal dystrophy, Rod-cone dystrophy, Hepatic fibrosis, Sensorineural hearing impairment, Situs inversus totalis, Renal dysplasia, Hepatic steatosis
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