SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID316.00
Renale tubuläre Dysgenesie (RTD) : 4 Gene (7,653 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 2 - 4 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ACE 106180 AR Renale tubuläre Dysgenesie (RTD) SNV und CNV: Short Read NGS
AGT 106165 AR Renale tubuläre Dysgenesie (RTD) SNV und CNV: Short Read NGS
AGTR1 106150 AR Renale tubuläre Dysgenesie (RTD) SNV und CNV: Short Read NGS
REN 179820 AR Renale tubuläre Dysgenesie (RTD) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Renale tubuläre Dysgenesie (RTD)
ACE, AGT, AGTR1, REN
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACE, AGT, AGTR1, REN
HPO Terms
Renal tubular dysgenesis, Abnormality of the urinary system, Hypotension, Potter facies, Pulmonary hypoplasia, Respiratory insufficiency, Anuria, Widely patent fontanelles and sutures, Microcephaly, Oligohydramnios, Renal hypoplasia, Focal segmental glomerulosclerosis, Proteinuria, Renal tubular atrophy, Hyperuricemia, Hyperechogenic kidneys, Tubulointerstitial fibrosis, Chronic kidney disease, Anemia, Elevated mean arterial pressure
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