SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID269.03
Hypophosphatasie, Hypophosphatämie und Rachitis : 16 Gene (27,822 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ALPL 146300 AD, AR Hypophosphatasie, adulte Form (HPPA) SNV und CNV: Short Read NGS
ALPL 241510 AR Hypophosphatasie, kindliche Form (HPPC) SNV und CNV: Short Read NGS
ALPL 241500 AR Hypophosphatasie, schwere infantile Form (HPPI) SNV und CNV: Short Read NGS
ALPL 241500 AR Hypophosphatasie, schwere perinatale Form (HPPN) SNV und CNV: Short Read NGS
CLCN5 300554 XLR Hypophosphatämische Rachitis SNV und CNV: Short Read NGS
CYP2R1 600081 AR Vitamin-D-abhängige Rachitis (VDDR1B) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP3A4 619073 AD Vitamin-D-abhängige Rachitis (VDDR3) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP27B1 264700 AR Vitamin-D-abhängige Rachitis (VDDR1A) SNV und CNV: Short Read NGS
DMP1 241520 AR Hypophosphatämische Rachitis (ARHR1) SNV und CNV: Short Read NGS
ENPP1 613312 AR Hypophosphatämische Rachitis (ARHR2) SNV und CNV: Short Read NGS
FAH 276700 AR Hypophosphatämische Rachitis und Tyrosinämie (TYRSN1) SNV und CNV: Short Read NGS
FAM20C 259775 AR Hypophosphatämische Rachitis, Zahnanomalien und ektopische Kazifikation SNV und CNV: Short Read NGS
FGF23 193100 AD Hypophosphatämische Rachitis (ADHR) SNV und CNV: Short Read NGS
KL 612089 AR Hypophosphatämische Rachitis und Hyperparathyreoidismus SNV und CNV: Short Read NGS
NHERF1 612287 AD Hypophosphatämische Nephrolithiasis/Osteoporose (NPHLOP2) SNV und CNV: Short Read NGS
PHEX 307800 XLD Hypophosphatämische Rachitis (XLHR) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC34A1 613388 AR Hypophosphatämische Rachitis und Hyperkalziurie (FRTS2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC34A1 612286 AD Hypophosphatämische Nephrolithiasis/Osteoporose (NPHLOP1) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC34A3 241530 AR Hypophosphatämische Rachitis und Hyperkalziurie (HHRH) SNV und CNV: Short Read NGS
VDR 277440 AR Vitamin-D-abhängige Rachitis (VDDR2A) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hypophosphatämische Rachitis (HR)
CLCN5, DMP1, ENPP1, FAM20C, FGF23, NHERF1, PHEX, SLC34A1, SLC34A3
Vitamin-D-abhängige hypophosphatämische Rachitis (VDDR)
CYP27B1, CYP2R1, CYP3A4, VDR
Hypophosphatasie (HPP)
ALPL
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ALPL, CLCN5, CYP27B1, CYP2R1, CYP3A4, DMP1, ENPP1, FAH, FAM20C, FGF23, KL, NHERF1, PHEX, SLC34A1, SLC34A3, VDR
HPO Terms
Elevated alkaline phosphatase of bone origin, Premature loss of primary teeth, Premature loss of permanent teeth, Enamel hypoplasia, Enamel hypomineralization, Bone fracture, Metaphyseal cupping, Metaphyseal irregularity, Platyspondyly, Bowing of the legs, Rachitic rosary, Rickets, Osteomalacia, Bone pain, Hypophosphatemia, Renal phosphate wasting, Polyuria, Short stature, Skeletal dysplasia, Hyperphosphaturia
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