SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID266.01
Kabuki-Syndrom (KABUK) : 3 Gene (23,451 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 4 - 6 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ARHGAP29 610496 AD Orofaziale Spalte (OFC) SNV und CNV: Short Read NGS
BMP4 600625 AD Orofaziale Spalte (OFC11) SNV und CNV: Short Read NGS
BRD4 620568 AD Cornelia-de-Lange-Syndrom (CDLS6) SNV und CNV: Short Read NGS
C2CD3 615948 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD14) SNV und CNV: Short Read NGS
CDH1 119580 AD Blepharocheilodontisches Syndrom (BCDS1) SNV und CNV: Short Read NGS
CDH11 619736 AD Teebi-Hypertelorismus-Syndrom (TBHS2) SNV und CNV: Short Read NGS
CHD7 214800 AD CHARGE-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
CPLANE1 277170 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD6) SNV und CNV: Short Read NGS
CYFIP1 620568 AD Burnside-Butler-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
DDX59 174300 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD5) SNV und CNV: Short Read NGS
DHCR7 270400 AR Smith-Lemli-Opitz-Syndrom (SLOS) SNV und CNV: Short Read NGS
DLX4 616788 AD Orofaziale Spalte (OFC15) SNV und CNV: Short Read NGS
ESCO2 268300 AR Juberg-Hayward-Syndrom (JHS) SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR1 615465 AD Hartsfield-Syndrom (HRTFDS) SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR2 101200 AD Apert-Syndrom (ACS1) SNV und CNV: Short Read NGS
FLNB 150250 AD Larsen-Syndrom (LRS) SNV und CNV: Short Read NGS
GRHL3 606713 AD Van-der-Woude-Syndrom (VWS2) SNV und CNV: Short Read NGS
HDAC8 300882 XLD Cornelia-de-Lange-Syndrom (CDLS5) SNV und CNV: Short Read NGS
IFT57 617927 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD18) SNV und CNV: Short Read NGS
INTU 617926 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD17) SNV und CNV: Short Read NGS
IRF6 608864 AD Orofaziale Spalte (OFC6) SNV und CNV: Short Read NGS
IRF6 119300 AD Van-der-Woude-Syndrom (VWS1) SNV und CNV: Short Read NGS
IRF6 119500 AD Popliteales Pterygium-Syndrom (PPS) SNV und CNV: Short Read NGS
KDM1A 616728 AD Kabuki-Syndrom (CPRF) SNV und CNV: Short Read NGS
KDM6A 300867 XLD Kabuki-Syndrom (KABUK2) SNV und CNV: Short Read NGS
KIAA0753 617127 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD15) SNV und CNV: Short Read NGS
KMT2D 147920 AD Kabuki-Syndrom (KABUK1) SNV und CNV: Short Read NGS
LRRC32 619074 AR CPPRDD-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
MEIS2 600987 AD CPCMR-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
MID1 300000 XLR Opitz-GBBB-Syndrom (GBBB1) SNV und CNV: Short Read NGS
MSX1 608874 AD Orofaziale Spalte (OFC5) SNV und CNV: Short Read NGS
NECTIN1 225060 AD Orofaziale Spalte (OFC7) SNV und CNV: Short Read NGS
NEK1 252100 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD2) SNV und CNV: Short Read NGS
NIPA1 620568 AD Burnside-Butler-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
NIPA2 620568 AD Burnside-Butler-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
NIPBL 122470 AD Cornelia-de-Lange-Syndrom (CDLS1) SNV und CNV: Short Read NGS
OFD1 311200 XLD Orofaziodigitales Syndrom (OFD1) SNV und CNV: Short Read NGS
RAB34 620718 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD20) SNV und CNV: Short Read NGS
RAD21 614701 AD Cornelia-de-Lange-Syndrom (CDLS4) SNV und CNV: Short Read NGS
RIPK4 263650 AR Bartsocas-Papas-Syndrom (BPS) SNV und CNV: Short Read NGS
SCNM1 620107 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD19) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC26A2 222600 AR Diastrophe Dysplasie (DTD) SNV und CNV: Short Read NGS
SMC1A 300590 XLD Cornelia-de-Lange-Syndrom (CDLS2) SNV und CNV: Short Read NGS
SMC3 610759 AD Cornelia-de-Lange-Syndrom (CDLS3) SNV und CNV: Short Read NGS
SPECC1L 145410 AD Teebi-Hypertelorismus-Syndrom (TBHS1) SNV und CNV: Short Read NGS
TBX22 303400 XL Orofaziale Spalte (CPX) SNV und CNV: Short Read NGS
TCTN3 258860 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD4) SNV und CNV: Short Read NGS
TGDS 616145 AR Catel-Manzke-Syndrom (CATMANS) SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM107 617563 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD16) SNV und CNV: Short Read NGS
TP63 618149 AD Orofaziale Spalte (OFC8) SNV und CNV: Short Read NGS
TP63 604292 AD EEC-Syndrom (EEC3) SNV und CNV: Short Read NGS
TUBGCP5 620568 AD Burnside-Butler-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
ZRSR2 301132 XLR Orofaziodigitales Syndrom (OFD21) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Orofaziale Spalte, nicht-syndromal (OFC)
ARHGAP29, BMP4, DLX4, GRHL3, IRF6, MSX1, NECTIN1, TBX22, TP63
Orofaziodigitales Syndrom (OFD)
C2CD3, CPLANE1, DDX59, IFT57, INTU, KIAA0753, NEK1, OFD1, RAB34, SCNM1, TCTN3, TMEM107, ZRSR2
Cornelia-de-Lange-Syndrom (CDLS)
BRD4, HDAC8, NIPBL, RAD21, SMC1A, SMC3
Kabuki-Syndrom (KABUK)
KDM1A, KDM6A, KMT2D
Van-der-Woude-Syndrom (VWS)
GRHL3, IRF6
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
KDM1A, KDM6A, KMT2D
HPO Terms
Cleft lip, Cleft palate, Cleft lip and palate, Bilateral cleft lip, Unilateral cleft lip, Cleft palate with no cleft lip, Cleft lip without cleft palate, Submucous cleft palate, Cleft lip with alveolar cleft, Cleft palate with alveolar cleft, Cleft lip and alveolus, Cleft palate and alveolus, Cleft lip and palate with alveolus, Cleft lip with submucous cleft, Cleft palate with submucous cleft, Cleft lip with maxillary cleft, Cleft palate with maxillary cleft, Cleft lip with mandibular cleft, Cleft palate with mandibular cleft
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