SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID115.02
Osteoporose : 15 Gene (39,000 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
CALCR 166710 AD Osteoporose SNV und CNV: Short Read NGS
COL1A1 166710 AD Osteoporose SNV und CNV: Short Read NGS
COL1A2 166710 AD Osteoporose SNV und CNV: Short Read NGS
COPB2 619884 AD Osteoporose mit Entwicklungsstörung (OPDD) SNV und CNV: Short Read NGS
ESR1 166710 AD Osteoporose (BMND) SNV und CNV: Short Read NGS
LGR4 615311 AD Osteoporose (BMND17) SNV und CNV: Short Read NGS
LRP5 166710 AD Osteoporose SNV und CNV: Short Read NGS
LRP5 259770 AR Osteoporose-Pseudogliom-Syndrom (OPPG) SNV und CNV: Short Read NGS
NHERF1 612287 AD Nephrolithiasis-Osteoporose-Syndrom (NPHLOP2) SNV und CNV: Short Read NGS
NOTCH2 102500 AD Osteoporose-Syndrom (HJCYS) SNV und CNV: Short Read NGS
PLS3 300910 XLD Osteoporose (BMND18) SNV und CNV: Short Read NGS
SGMS2 126550 AD Osteoporose-Syndrom (CDL) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC34A1 612286 AD Nephrolithiasis-Osteoporose-Syndrom (NPHLOP1) SNV und CNV: Short Read NGS
VDR 166710 AD Osteoporose SNV und CNV: Short Read NGS
WNT1 615221 AD Osteoporose (BMND16) SNV und CNV: Short Read NGS
WNT11 166710 AD Osteoporose SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Osteoporose
CALCR, COL1A1, COL1A2, COPB2, ESR1, LGR4, LRP5, LRP5, NHERF1, NOTCH2, PLS3, SGMS2, SLC34A1, VDR, WNT1, WNT11
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CALCR, COL1A1, COL1A2, COPB2, ESR1, LGR4, LRP5, NHERF1, NOTCH2, PLS3, SGMS2, SLC34A1, VDR, WNT1, WNT11
HPO Terms
Osteoporosis, Reduced bone mineral density, Osteopenia, Increased susceptibility to fractures, Multiple prenatal fractures, Pathologic fracture, Multiple rib fractures, Bowing of limbs due to multiple fractures, Abnormal bone structure, Subperiosteal bone resorption, Thin ribs, Thin bony cortex, Hyperparathyroidism, Secondary hyperparathyroidism, Osteolysis, Bone cyst, Increased circulating beta-C-terminal telopeptide concentration, Hypercalciuria, Hypercalcemia, Osteomalacia
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