SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID249.01
3-Methylglutaconazidurie (MGCA) : 16 Gene (18,888 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AGK 212350 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom (MTDPS10) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP5F1D 618120 AR Mitochondrialer Komplex-V-Mangel (MC5DN5) SNV und CNV: Short Read NGS
ATP5F1E 614053 AR Mitochondrialer Komplex-V-Mangel (MC5DN3) SNV und CNV: Short Read NGS
ATPAF2 604273 AR Mitochondrialer Komplex-V-Mangel (MC5DN1) SNV und CNV: Short Read NGS
AUH 250950 AR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA1) SNV und CNV: Short Read NGS
CLPB 619835 AD 3-Methylglutaconazidurie (MGCA7A) SNV und CNV: Short Read NGS
CLPB 616271 AR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA7B) SNV und CNV: Short Read NGS
DNAJC19 610198 AR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA5) SNV und CNV: Short Read NGS
ECHS1 616277 AR Mitochondrialer Enoyl-CoA-Hydratase-Mangel (ECHS1D) SNV und CNV: Short Read NGS
HTRA2 617248 AR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA8) SNV und CNV: Short Read NGS
OPA3 258501 AR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA3) SNV und CNV: Short Read NGS
POLG 303700 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom (MTDPS4A) SNV und CNV: Short Read NGS
SERAC1 614739 AR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA6, MEGDEL) SNV und CNV: Short Read NGS
SUCLA2 612073 AR Mitochondriales DNA-Depletionssyndrom (MTDPS5) SNV und CNV: Short Read NGS
TAFAZZIN 302060 XLR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA2, BTHS) SNV und CNV: Short Read NGS
TIMM50 617698 AR 3-Methylglutaconazidurie (MGCA9) SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM70 614052 AR Mitochondrialer Komplex-V-Mangel (MC5DN2) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
3-Methylglutaconazidurie (MGCA)
AGK, ATP5F1D, ATP5F1E, ATPAF2, AUH, CLPB, CLPB, DNAJC19, ECHS1, HTRA2, OPA3, POLG, SERAC1, SUCLA2, TAFAZZIN, TIMM50, TMEM70
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AGK, ATP5F1D, ATP5F1E, ATPAF2, AUH, CLPB, DNAJC19, ECHS1, HTRA2, OPA3, POLG, SERAC1, SUCLA2, TAFAZZIN, TIMM50, TMEM70
HPO Terms
3-Methylglutaconic aciduria, Increased circulating lactate concentration, Lactic acidosis, Generalized hypotonia, Global developmental delay, Seizure, Cerebellar atrophy, Optic atrophy, Cataract, Hypertrophic cardiomyopathy, Dilated cardiomyopathy, Arrhythmia, Sensorineural hearing impairment, Hepatomegaly, Growth delay, Muscle weakness, Peripheral neuropathy, Abnormal cerebral white matter morphology, Elevated circulating creatine kinase concentration, Respiratory insufficiency
scroll to top