SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID191.01
Homocystinurie : 9 Gene (15,306 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ABCD4 614857 AR Methylmalonazidurie - Homocystinurie (MAHCJ) SNV und CNV: Short Read NGS
CBS 236200 AR Homocystinurie durch CBS-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
LMBRD1 277380 AR Methylmalonazidurie - Homocystinurie (MAHCF) SNV und CNV: Short Read NGS
MMACHC 277400 AR Methylmalonazidurie - Homocystinurie (MAHCC) SNV und CNV: Short Read NGS
MMADHC 277410 AR Methylmalonazidurie - Homocystinurie (MAHCD) SNV und CNV: Short Read NGS
MTHFR 236250 AR Homocystinurie durch MTHFR-Mangel SNV und CNV: Short Read NGS
MTR 250940 AR Homocystinurie – Megaloblastäre Anämie (HMAG) SNV und CNV: Short Read NGS
MTRR 236270 AR Homocystinurie – Megaloblastäre Anämie (HMAE) SNV und CNV: Short Read NGS
PRDX1 277400 AR Methylmalonazidurie - Homocystinurie (MAHCC) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Homocystinurie
ABCD4, CBS, LMBRD1, MMACHC, MMADHC, MTHFR, MTR, MTRR, PRDX1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ABCD4, CBS, LMBRD1, MMACHC, MMADHC, MTHFR, MTR, MTRR, PRDX1
HPO Terms
Homocystinuria, Hyperhomocystinemia, Hypomethioninemia, Decreased methionine synthase activity, Lens subluxation, Ectopia lentis, Micrognathia, Hypertelorism, Wide intermamillary distance, Microcephaly, Intellectual disability, Developmental delay, Seizure, Ataxia, Dysarthria, Coarctation of aorta, Patent ductus arteriosus, Atrial septal defect, Venous thrombosis, Arterial thrombosis
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