SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID089.04
Pankreaskarzinom : 19 Gene (59,922 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
APC 260350 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
ATM 260350 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
BARD1 260350 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA1 614320 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs (PNCA4) SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA2 613347 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs (PNCA2) SNV und CNV: Short Read NGS
CDKN2A 606719 AD Melanom-Pankreaskarzinom-Syndrom (FAMMMPC) SNV und CNV: Short Read NGS
CHEK2 609265 AD Tumor-Prädispositionssyndrom (TPDS4) SNV und CNV: Short Read NGS
EPCAM 613244 AD Lynch-Syndrom (LYNCH8) SNV und CNV: Short Read NGS
MLH1 609310 AD Lynch-Syndrom (LYNCH2) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH2 120435 AD Lynch-Syndrom (LYNCH1) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH6 614350 AD Lynch-Syndrom (LYNCH5) SNV und CNV: Short Read NGS
PALB2 613348 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs (PNCA3) SNV und CNV: Short Read NGS
PMS2 614337 AD Lynch-Syndrom (LYNCH4) SNV und CNV: Short Read NGS
PRSS1 167800 AD Hereditäre Pankreatitis (PCTT) SNV und CNV: Short Read NGS
SPINK1 167800 AD Hereditäre Pankreatitis (PCTT) SNV und CNV: Short Read NGS
STK11 260350 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
TP53 151623 AD Tumor-Prädispositionssyndrom (LFS1) SNV und CNV: Short Read NGS
VHL 260350 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
WT1 260350 AD Prädisposition für Bauchspeicheldrüsenkrebs SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Pankreaskarzinom
APC, ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CHEK2, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PALB2, PMS2, PRSS1, SPINK1, STK11, TP53, VHL, WT1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
APC, ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CHEK2, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PALB2, PMS2, PRSS1, SPINK1, STK11, TP53, VHL, WT1
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