SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID140.03
Prostatakarzinom : 30 Gene (101,454 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 4 - 6 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
AR
ATM
ATR
BAP1
BARD1
BRCA1
BRCA2
BRIP1
CDH1
CHEK2
CYP3A43
ELAC2
EPCAM
FANCM
HOXB13
MLH1
MRE11
MSH2
MSH6
MSR1
NBN
PALB2
PMS2
PTEN
RAD51C
RAD51D
RECQL
RNASEL
TP53
TRRAP
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AR, ATM, ATR, BAP1, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CDH1, CHEK2, CYP3A43, ELAC2, EPCAM, FANCM, HOXB13, MLH1, MRE11, MSH2, MSH6, MSR1, NBN, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51C, RAD51D, RECQL, RNASEL, TP53, TRRAP
HPO Terms
Prostate cancer, Pain, Fatigue, Anemia, Abnormal B cell count, Abnormal platelet count, Abnormal lymphocyte count, Abnormal leukocyte count, Abnormality of the endocrine system, Abnormality of the immune system, Abnormality of the cardiovascular system, Abnormality of the respiratory system, Abnormality of the urinary system, Abnormality of the skeletal system, Abnormality of the digestive system, Abnormality of the reproductive system, Abnormality of the nervous system, Abnormality of the skin, Abnormality of the hair, Abnormality of the eye
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